Laboratorij za biotehnologiju u akvakulturi

Laboratorij za biotehnologiju u akvakulturi

Laboratorij za biotehnologiju u akvakulturi (LAB) bavi se proučavanjem interakcije učinaka akvakulture i okoliša sa kemijskog i biološkog aspekta, kao i istraživanjem fizioloških i molekularnih svojstava organizama koji žive u vodi (ribe, rakovi, školjkaši, alge) radi unaprijeđenja tehnologija uzgoja, uvođenja novih vrsta u uzgoj te istraživanja ekoloških pristupa akvakulturnoj proizvodnji.

LAB (prijašnji naziv: LIBM) 2006. godine suosnovao je Hrvatski centar za autohtone vrste riba i rakova krških voda u Otočcu (http://www.pastrveituristi.otocac.hr/

left right

Znanstvena djelatnost LAB-a provodi se u okviru nekoliko istraživačkih tema:
a) Dijagnostika
• Razvoj, unaprijeđenje i prilagodba novih dijagnostičkih metoda/tehnika za procjenu i otkrivanje fizioloških/metaboličkih reakcija
• Razvoj i procjena bioloških indikatora stresa za postojeće i novouvedene uzgojne vrste
• Razvoj bioloških markera za detekciju disbalansa ekosustava na različitim razinama biološke organizacije
b) Imunomodulatori
• Istraživanje učinaka imunomodulatora na imunosni sustav (obrambenih mehanizama i reakcija) vodnih organizama te razvoj novih imunomodulatorskih bioaktivnih komponenti za primjenu u akvakulturi
c) Nove vrste u akvakulturi
• Uvođenje novih vrsta u akvakulturu
• Uvođenje, razvoj i harmonizacija metoda temeljenih na -omics istraživanjima u svrhu boljeg poznavanja fizioloških procesa novouvedenih vrsta u uvjetima uzgoja, prilagodbe postojećih tehnologija novim vrstama te unaprijeđenja kvalitete i zdravlja makrobiota

Biotehnološki pristup uz korištenje biokemijskih (kolorimetrijska, spektrofotometrijska, masena spektrometrija, plinska kromatografija, tekućinska kromatografija), histoloških/histokemijskih, mikrobioloških, molekularnih, elektrokemijskih metoda i tehnika uz numeričko modeliranje i inovativne tehnologije uzgoja, značajno doprinosi boljem razumijevanju interakcije akvakulture i okoliša:
a) Mikrobiološka istraživanja
• Istraživanje mikrobioma vodenih ekosustava molekularnim metodama za karakterizaciju mikroorganizama u okolišu
b) Ispitivanja toksičnosti
• Procjena potencijalne toksičnosti prirodnih spojeva uz pomoć brojnih biotestova kojima se testiraju učinci na različitim razinama biološke organizacije (primjena bakterijskih sojeva, akvatičnih i terestrijalnih vrsta kao modelnih organizama u procjeni bioaktivnih supstanci)
• Unaprijeđenje postojećih i razvoj novih biomarkera za testiranje širokog spektra potencijalno toksičnih spojeva
c) Karakterizacija antioksidansa
• Razvoj i validacija jednostavne, brze, pouzdane i osjetljive elektrokemijske metode za određivanje ukupnog antioksidativnog kapaciteta, pogodne za rutinske analize hrane u istraživačkim laboratorijima i industriji
• Detaljno ispitivanje mehanizama elektrokemijskog i antioksidativnog djelovanja antioksidativnih spojeva
d) Modeliranje vodenih ekosustava
• Analiza fizikalnih svojstava mora i formacije vodenih masa te izmjene topline između mora i zraka
• Analiza i modeliranje fizikalnih procesa u moru

Ivančica Strunjak-Perović
dr.sc.

viša znanstvena suradnica
+385 1 457 1232
1785

Josip Barišić

+385 1 457 1232
1785

Lara Čižmek
mag. ing. oecoing.

+385 1 456 1181
1581

Margita Jadan
Dr. sc.

Znanstvena suradnica
+385 1 456 1097
1497

Maro Bujak
dr.sc.

viši stručni suradnik
1837

Natalija Topić Popović
dr.sc.

viša znanstvena suradnica
+385 1 457 1232
1785 1793

Rozelindra Čož-Rakovac
dr.sc.

znanstvena savjetnica
+385 1 457 1232
1785

Sandi Orlić
dr.sc.

Viši znanstveni suradnik
+38598778806

BioProCro, Znanstveni centar izvrsnosti

BioProCro jedinstveni je trans-disciplinarni centar za biotehnološko istraživanje Jadranskog mora u Republici Hrvatskoj, izrađen na čvrstom temelju znanstvene izvrsnosti stručnjaka s Instituta Ruđer Bošković, Sveučilišta u Splitu (Kemijsko-tehnološki fakultet), Zagrebu (Prehrambeno-biotehnološki fakultet), Rijeci (Odjel za biotehnologiju) i Osijeku (Prehrambeno-tehnološki fakultet).

više »

H2020 - PerformFISH: Consumer Driven Production: Integrating Innovative Approaches for Competitive and Sustainable Performance across the Mediterran...

PerformFISH, Horizon 2020 – Research and Innovation Framework Programme

Full Title: Consumer Driven Production: Integrating Innovative Approaches for Competitive and Sustainable Performance across the Mediterranean Aquaculture Value Chain

više »
Dijagnostika i terapija bolesti riba, rakova i školjkaša

Dijagnostika i terapija bolesti riba, rakova i školjkaša

Osoblje Laboratorija za biotehnologiju u akvakulturi (LAB) ima dugogodišnje stručno iskustvo u dijagnostici, preventivi, liječenju i suzbijanju bolesti riba, rakova i školjkaša. Laboratorij je nositelj brojnih ugovora o zdravstvenoj zaštiti slatkovodnih riba u uzgajalištima, kao i zdravstvenoj zaštiti uzgajanih morskih riba u Hrvatskoj i Sloveniji.

više »
Procjena mutagenog potencijala AMES bakterijskim testom

Procjena mutagenog potencijala AMES bakterijskim testom

AMES bakterijskim testom određuje se da li je istraživana tvar (lijek, dodatak hrani, industrijska kemikalija, uzorak iz okoliša) mutagena.

više »
  • Analitička vaga ABS-N/ABJ-NM (Kern) – vaga s prikazom 4 decimale, maksimalne mase vaganja do 120 g.
  • Centrifuga 5417 C (Eppendorf) – uređaj za centrifugiranje epica volumena do 2 mL pri najvećoj brzini okretaja od 20.800 rcf (14.000 rpm).
  • Centrifuga 5804 R (Eppendorf) – uređaj za centrifugiranje različitih volumena u epicama od 0.2 – 2 ml, 15 ml, 50 ml i 250 ml, sa pripadajućim rotorima te mogućnošću hlađenja od -5 do 40 °C. Broj okretaja od 200-14.000 rpm.
  • Termotresilica TermoMixer C (Eppendorf) – uređaj za miješanje i grijanje svih tubica i ploča formata od 5 µl do 50 ml na temperature od 1 – 100 °C. Frekvencija miješanja od 300 – 3.000 rpm.
  • Magnetska miješalica RCT basic (IKA) – miješalica s grijanom pločom brzine miješanja OD 50 - 1.500 rpm, temperaturnog raspona od sobne temperature do 310 °C.
  • Spektrofotofluorimetar Infinite 200 PRO (Tecan) – fluorescencijski čitač mikrotitar ploča s mogućnošću mjerenja absorbancije, fluorescencije, luminiscencije te koncentracije DNA/RNA u nano volumenima. Raspon mjerenja od 230-1.000 nm.
  • Fluorescentni svjetlosni mikroskop Olympus BX51 sa pripadajućom digitanlom kamerom DP70 – mikroskop maksimalnog povećanja od 2.000 x, sa softverom za analizu slike. Postojeći objektivi 4, 10, 20, 40 i 100 x.
  • Invertni mikroskop EC3 (Leica) - invertni mikroskop s integriranom optikom, LED osvjetljenjem za prolazno svijetlo i pripadajućom color digitalnom EC3 kamerom. Objektivi: 4x/0.10; 10x/0.25; 20x/0.30; 40x/0.65.
  • Stereomikroskop S6E (Leica) – povećanje od 6.3 – 40 puta, radne udaljenosti minimalno 110 mm, sa 3 svjetla za obligue iluminaciju.
  • Histokinet TP 1020 (Leica) – automatski tkivni procesor s vakumskom pompom od 500 hPa (cca. 0.5 bara) za dehidraciju tkiva. Instrument posjeduje 10 aluminijskih kontejnera, maksimalnog kapaciteta do 80 kazeta.
  • Mikrotom RM 225 (Leica) – uređaj za rezanje parafinskih blokova u svrhu dobivanja prepreza tkiva debljine od 1 do 60 µm.
  • Vodena kupelj HI210 (Leica) – vodena kupelj koja omogućuje transfer tkivnih prereza na predmetnicu. Raspon temperature kreće se između sobne temperature i  75 °C.
  • Parafin dispenzor EG 1120 (Leica) – uređaj za uklapanje tkiva u parafinske blokove. Nakon zagrijavanja na maksimalno 70 °C, protok parafina može se regulirati po potrebi.
  • Digestor SafeAire 1000 GS – uređaj za eliminaciju potencijalno štetnih para i dima u svrhu zaštite operatora i okoliša, opremljen sa predfilterom, filterom te alarmom.  
  • Inkubator Haerus BK 160 (Kendro Lab. Products) – inkubator s hlađenjem zapremine 166 l.
  • Inkubatorska tresilica Innova 42 (Eppendorf) – inkubatorska tresilica s hlađenjem i ugrađenim fotosintetskim svjetlom, temperaturnog raspona od 4-80°C, brzina miješanja od 25-400 rpm te pripadajućim nosačem za 30 tubica.
  • Autoklav AL02-06 (Adventage Lab) – uređaj za sterilizaciju laboratorijskog pribora vertikalnog radnog prostora volumena 40 l. Radna temperature od 60 – 137 °C, sa ugrađenim alarmom te sigurnosnom kontakt bravom na vratima uređaja.
  • Laminar Heraeus - Herasafe HS9 (Kendro Lab. Products) – Biozaštitna oprema klasa II, volumen protoka zraka 840 m3/h, sa ugrađenim UV lampama.
  • Zamrzivač Heraeus - Herafreeze HFU 586 basic (Kendro Lab. Products)  – uređaj za pohranu i zamrzavanje uzoraka na -86 °C, ukupne zapremine 510 l.
  • Mastercycler (Eppendorf) - PCR-uređaj s 96 mjesta u formatu 12 x 8 bunarčića. Uređaj ima grijani poklopac te vrlo precizno kontrolira temperaturu. Najviša brzina promjene temperature bloka iznosi 6° C/s. Gradijentni blok s 12 redova u kojima je moguće programirati
  • Thermomixer comfort (Eppendorf) - Uređaj omogućava istovremeno miješanje uzoraka i kontrolu temperature. Termoblok s 24 mjesta (6 x 4) za epruvetice od 1,5 mL . Temperaturni raspon od 13°C ispod sobne temperature do 99°C s brzinom grijanja od 5°C/ minuti. Brzina miješanja od 300 do 1500 rpm.
  • Syngene U:GENIUS (Syngene) – Uređaj za vizualizaciju i dokumentaciju gelova koji koristi UV transiluminator. Mogućnost zamjene filtera ovisno o tipu transiluminatora. Kamera od 3MP s ručnim podešavanjem povećanja i fokusa.
  • MP-300 V (major science) power supply - Izvor struje za DNA, RNA i proteinsku gel-elektroforezu. Uređaj ima mogućnost spajanja 4 para vanjskih terminala (kadica za elektroforezu) s izlaznim naponom od 2 – 300 V.