Sekvenciranje DNA

Sekvenciranje DNA

U Zavodu za molekularnu biologiju (Laboratorij za molekularnu genetiku) početkom 2005. godine pušten je u rad "DNA sekvenator", odnosno uređaj "ABI PRISM® 3100-Avant Genetic Analyzer".

Uputstva za korisnike

UPUTSTVA ZA PRIPREMU UZORAKA ZA REAKCIJU ODREĐIVANJA PRIMARNE STRUKTURE DNA

 

VAŽNOST PROČIŠĆAVANJA KALUPA

Za optimalne rezultate potrebno je kvalitetno pročistiti PCR-produkte prije sekvenciranja nekim od standardnih kitova za pročišćavanje PCR produkta iz gela.

Plazmidi također trebaju biti izolirani pomoću nekog od standardnih kitova za izolaciju plazmida ili pročišćeni kroz kolonicu.

KOLIČINA KALUPA:

Plazmid: 200-500 ng

PCR produkti: 50-500 ng, ovisno o veličini

maksimalni volumen: 13 mikrolitara

KOLIČINA KLICE:

Po jednoj reakciji dodaje se 1 mikrolitar klice (primer, početnica) koncentracije 3.2 pmol/mikrolitru.

Za što bolje i brže rezultate savjetujem da u tubici na ledu donesete već pomiješano 13 mikrolitara kalupa i 1 mikrolitar klice, te da tubicu označite što jednostavnije (najbolje početno slovo imena ili prezimena i broj).

Također je važno da je kalup otopljen u vodi ili puferu koji ne sadrži EDTA.

Sekvence se rade svakog četvrtka. Molimo da se uzorci donesu dan ranije.

Cijene za jednu analizu određivanja primarne strukture DNA su:

1. za korisnike unutar IRB-a 85,00 kn
2. za korisnike unutar akademske zajednice  100,00 kn+PDV
3. za ostale korisnike 125,00 kn+PDV

Korisnici unutar IRB-a plaćaju nalogom koji mogu dobiti u DNA servisu. Ostali korisnici trebaju dostaviti narudžbenicu s matičnim brojem ustanove na ime Dr. sc. Helena Ćetković.

Voditeljica servisa:

Helena Ćetković

Helena Ćetković, dr. sc.

viša znanstvena suradnica +385 1 456 1115