David Matthew Smith

David Matthew Smith

dr. sc.

znanstveni savjetnik
predstojnik zavod
+385 1 456 1182

1382

+385 1 456 1182

Krilo 6/203

Zavod za fizičku kemiju
Bijenička cesta 54, P.P. 180
HR-10002 Zagreb
Hrvatska

Radovi na IRB

CV_DMS_HR_May16.pdf 189,62 kB

Obrazovanje

  • 01.96. – 09.99. Doktorski studij: Research School of Chemistry, Australian National University, Canberra, ACT, Australia. Završen s najvišom ocjenom. Voditelj: Prof. Leo Radom. Disertacija: Theoretical Studies of Coenzyme-B12-Dependent Reactions
  • 03.95. – 11.95. Diplomski rad: Department of Chemistry, Australian National University. Završen s najvišom ocjenom  (first class honours in chemistry). Voditelj: Dr. Gad Fischer Radnja: An Ab Initio Study of the Electronic Spectrum of the Triazine Molecules
  • 03.91. – 11.94. Prvostupnički studij kemije i matematike (Bachelor of Science). Department of Chemistry, Australian National University, Canberra, AU.
  • 03.91. – 11.94. Prvostupnički studij ekonomije i statistike (Bachelor of Economics). Department of Economics, Australian National University, Canberra, AU.

Područja znanosti

fizikalna kemija

Projekti

  • 07.15–10.16: Glavni istraživač na projektu Europskog Socijalnog Fonda program za istraživačke stipendije za profesionalni razvoj mladih istraživača i poslijedoktoranada pod nazivom „Mreže za profesionalno usavršavanje mladih znanstvenika u interdisciplinarnim istraživanjima inovativnih površina i materijala“. Vrijednost 2 mil. HRK.
  • 01.15–12.19: Glavni istraživač projekta "Projekt razvoja karijera mladih istraživača - izobrazba novih doktora znanosti" (HRZZ) u vrijednosti 480 000 HRK.
  • 07.14. – 07.18.  Voditelj istraživački projekta Hrvatska Zaklada na Znanost pod nazivom Computational Solutions in the Life Sciences: The Importance of Molecular Flexibility (CompSoLS-MolFlex), u vrijednosti 900.000 HRK kroz četiri godine.
  • 09.13. – 10.15. Suradnik na projektu fonda Jedinstvo uz pomoć znanja pod nazivom Time resolved photoelectron spectroscopy as a probe for ultrafast excited state dynamics, unutar programa Research Cooperability, Crossing Borders, u vrijednosti 185.000 EUR kroz dvije godine.
  • 07.13. – 01.17. Voditelj Management Work Package projekta unutar Seventh Framework Programme, pod nazivom InnoMol (FP7- REGPOT-2012-2013-1), u vrijednosti 4,7 milijuna EUR.
  • 10.10. – 10.13.  Suradnik na projektu Computational Life Sciences on Open Shell Intermediates u okviru Research Group Linkage Programme. Projekt je financiran od strane Zaklade Alexander von Humboldt (AvH) u vrijednosti od 50,000 EUR na period od tri godine.
  • 04.07 – 04.10. Koordinator pojekta unutar Sixth Framework Programme (FP6), pod nazivom Reinforcement of the Centre for Computational Solutions in the Life Sciences (EU-FP6-043749-ReCompSoLS), financiranog od strane Europske komisije, u vrijednosti od 380,000 EUR za period od tri godine. Projekt je uspješno završen, a sva financijska sredstva u potpunosti su isplaćena i iskorištena.
  • 01.07. –  Voditelj temeljnog znanstvenog projekta Računalno proučavanje strukture i funkcije proteina (098-0982933-2937), financiranog od Ministarstva znanosti, obrazovanja i športa Republike Hrvatske, u vrijednosti od 90,000 HRK godišnje.
  • 04.05. – 12.06. Voditelj temeljnog znanstvenog projekta Računalno proučavanje strukture i funkcije proteina (0098151), financiranog od Ministarstva znanosti, obrazovanja i športa Republike Hrvatske, u vrijednosti od 30,000 HRK godišnje.

Nagrade i priznanja

  • 11.08.   Dobitnik Godišnje nagrade Hrvatskog kemijskog društva “Lavoslav Ružička” za 2008. godinu
  • 04.04. – 04.05.  Povratnička stipendija Zaklade Alexander von Humboldt za zemlje Srednje i Istočne Europe, za rad na Institutu Ruđer Bošković
  • 01.05.   Donacija Zaklade Alexander von Humboldt u obliku računalnog klastera vrijednog 20,000 EUR, instaliranog na Institutu Ruđer Bošković
  • 11.03. – 02.04.  Postdoktorska stipendija DFG (Deutsche Forschungsgemeinschaft) za rad na Kemijskom odjelu Sveučilišta Ludwig-Maximilians, München, Njemačka
  • 03.02. – 10.03.  Stipendija Zaklade Alexander von Humboldt (AvH) za boravak i rad na Kemijskom odjelu Sveučilišta Ludwig-Maximilians, München, Njemačka
  • 04.01.   Dobitnik Dekanove nagrade za kemiju, za najbolju disertaciju u 2000. godini, na Research School of Chemistry, Australian National University, Canberra, Australija
  • 01.96. – 09.99.  Stipendija australske države najboljim studentima za doktorski studij (Australian postgraduate award)
  • 03.95. – 11.95.  Stipendija Research School of Chemistry najboljim studentima za izradu diplomskog rada, Australian National University, Canberra, Australija
  • 12.94. – 03.95.  Summer Research Scholarship, stipendija najboljim studentima za izradu kratkog istraživačkog projekta, Research School of Chemistry, Australian National University, Canberra, Australija

Nastava

  • 10.11- Predavanja iz kolegija Računarska kemija u okviru poslijediplomskog studija Medicinska kemija na Sveučilištu u Rijeci.
  • 09.07 i 09.09  Praktikum iz metoda molekularne dinamike and QM/MM računa na znanstvenim skupovima u Opatiji i Primoštenu (vidi dolje organizacijske sposobnosti)
  • 03.95. – 10.98. Asistent na kolegiju Chemistry A11 (uvodni kolegij za studente prve godine dodpilomskog studija), Department of Chemistry, Australian National University.
  • 03.95. – 10.97. Pomoć pri učenju i instrukcije za velik broj srednjoškolskih učenika, za područje kemije, matematike, fizike i ekonomije.
  • 10.11   Predavanja iz kolegija Računarska kemija u okviru poslijediplomskog studija Medicinska kemija na Sveučilištu u Rijeci.
  • 09.07 i 09.09   Praktikum iz metoda molekularne dinamike and QM/MM računa na znanstvenim skupovima u Opatiji i Primoštenu (vidi dolje organizacijske sposobnosti)

Istaknute publikacije

Smith, D. M.; Golding, B. T.; Radom*, L. J. Am. Chem. Soc. 121 (1999), 9388-9399. Understanding the Mechanism of B12-Dependent Methlymalonyl-CoA Mutase: Partial-Proton-Transfer in Action.

Smith, D. M.; Golding, B. T.; Radom*, L. J. Am. Chem. Soc. 123 (2001), 1664-1675. Understanding the Mechanism of B12-Dependent Diol Dehydratase: A Synergistic Retro-Push-Pull Proposal.

Smith, D. M.; Buckel, W.; Zipse*, H. Angew. Chem. Int. Ed. 42 (2003), 1867-1870. Enhanced Acidity of Enoxy Radicals: Theoretical Validation of a 50 Year Old Mechanistic Proposal.

Čondić-Jurkić, K.; Perchyonok, V. T.; Zipse, H.; Smith*, D. M. J. Comput. Chem. 29 (2008), 2425–2433. On the Modeling of Arginine-Bound Carboxylates: A Case Study with Pyruvate Formate-Lyase.

Sandala*, G. M.; Smith*, D. M.; Radom*, L. Acc. Chem. Res. 43 (2010), 642-651. Modeling the Reactions Catalyzed by Coenzyme B12 Dependent Enzymes.

Bucher*, D.; Sandala*, G. M.; Durbeej, B.; Radom*, L.; Smith*, D. M. J. Am. Chem. Soc. 134 (2012), 1591-1599.  The Elusive 5'-Deoxyadenosyl Radical in Coenzyme-B12-Mediated Reactions.

Dragičević, I.; Barić*, D.; Kovačević, B.; Golding, B. T.; Smith*, D. M. Chem. Eur. J. 21 (2015), 6132-6143. Non-enzymatic Ribonucleotide Reduction in the Prebiotic Context.

Članstva u profesionalnim udrugama / društvima

  • 05. – American Chemical Society
  • 04. – World Association of Theoretically Oriented Chemists
  • 04. – Hrvatsko kemijsko društvo
  • 96. – 03. Royal Australian Chemical Institute

Ostalo

RADNO ISKUSTVO

06.16 -:. Predstojnik zavod i znanstveni savjetnik, Zavod za fizičku kemiju (ZFK), Institut Ruđer Bošković (IRB), Zagreb.

01.16 -:05.16. v.d. predstojnik Zavod za fizičku kemiju (ZFK), Institut Ruđer Bošković (IRB), Zagreb.

02.14 -02.16.: Znanstveni savjetnik, Zavod za organsku kemiju i biokemiju (ZOKB), Institut Ruđer Bošković (IRB), Zagreb.

10.09 -01.14: Pomoćnik ravnatelja za međunarodnu suradnju i projekte (IRB).

10.09-: Gostujući profesor, grozda izvrsnosti: „Projektiranje naprednih materijala“ (Excellence Cluster for Engineering of Advanced Materials - EAM) na Friedrich-Alexanderovom Sveučilištu Erlangen-Nürnberg - FAU, Njemačka.

10.08-:02.16. Voditelj Grupe za kvantnu organsku kemiju (GKOK), ZOKB, IRB.

02.08-02.14: Viši znanstveni suradnik, GKOK, ZOKB, IRB

03.04-02.08: Znanstveni suradnik, GKOK, ZOKB, IRB.

USAVRŠAVANJE

Godina: 10.01. – 02.04.
Mjesto: München, Njemačka
Ustanova: Grupa za kvantnu kemiju na Zavodu za kemiju i farmaciju, Sveučilište Ludwig-Maximilians
Područje: poslijedoktorsko usavršavanje u računalnoj kemiji (klasična molekulska dinamika, računanje slobodne energije, računalna enzimologija)

Godina: 04.00. – 08.01.
Mjesto: Zagreb, Hrvatska
Ustanova: Grupa za kvantnu organsku kemiju na Zavodu za organsku kemiju i biokemiju, Institut Ruđer Bošković
Područje: poslijedoktorsko usavršavanje u računalnoj kemiji (multikonfiguracijske metode, konvergencija osnovnih skupova, korelacijska energija, računalna spektroskopija)