Dolazna mobilnost viših asistenata - Željka Pezer Sakač

Principal investigator

Project type
u tijeku
Programme
Dolazna mobilnost viših asistenata
Financier
Croatian Science Foundation
Start date
Mar 15th 2024
End date
Jun 14th 2025
Status
Done
Total cost
54375 EUR
More information

Strukturne varijante (inverzije, translokacije i varijacije u broju kopija) su dominantni oblik genetičkih varijacija. Zbog velikog udjela u genomu kojeg zahvaćaju i visoke stope mutacije, smatra se da imaju značajan utjecaj na fenotip, no nije jasno u kojoj mjeri na njih utječu okoliš i način života. Glavni cilj projekta je ustanoviti mogu li čimbenici poput prehrane i konzumacije alkohola izazvati promjene u učestalosti strukturnih varijacija u genomu reproduktivnih stanica. Takve se promjene mogu odraziti na zdravlje potomstva i evoluciju čitavih populacija. U ovom istraživanju, koje se provodi na modelu misa, po prvi puta u svijetu smo uspješno primijenili tehnologiju optičkog mapiranja za detekciju strukturnih varijanti u genomima spermijima, čime smo otvorili mogućnost novim primjenama ove tehnologije u području istraživanja evolucije i dijagnostici. Međutim, budući da je tehnologija optičkog mapiranja genoma dizajnirana prvenstveno za rad na ljudskom somatskom tkivu, potrebne su mnoge prilagodbe kako bi se mogla pouzdano primijeniti i na druge vrste. Osim optimizacije pripreme uzorka koja je dosad uspješno implementirana u projekt, pokazalo se da je potrebno prilagoditi algoritam za detekciju strukturnih varijanti kako bi se postigla veća preciznost i osjetljivost pri primjeni na genom misa. U sklopu usavršavanja na Institutu Ruđer Bošković, gostujući istraživač-biomatematičar će se baviti optimizacijom pristupa u detekciji strukturnih varijanti iz optičkih mapa genoma miša, koristeći se vještinama vezanima uz računalnu biologiju. Tijekom tog razdoblja steći će znanja i iskustvo u području istraživanja genomskih strukturnih varijacija, evolucijske biologije i evolucije genoma, te ovladati metodologijom obrade podataka dobivenih tehnologijom optičkog mapiranja genoma. Zbog novostečenog znanja, vještina i iskustva kroz rad na originalnom pristupu problematici, ovo će usavršavanje unaprijediti istraživačko-razvojne i inovacijske kapacitete gostujućeg istraživača ali i doprinijeti prijenosu znanja i vještina unutar Instituta. Osim toga, usavršavanje će doprinijeti stvaranju međunarodnih mreža te podizanju konkurentnosti i internacionalizaciji hrvatskog sustava istraživanja.Gostujući istraživač: dr. sc. Robert Schwieger