Primjena multi-omike u rasvjetljavanju interakcija signalnog puta Hedgehog i intratumorskog mikrobioma u nastanku seroznog raka jajnika visokog gradusa

Glavni istraživač

Tip projekta
u tijeku
Program
Istraživački projekti
Financijer
Hrvatska zaklada za znanost
Datum početka
12.10.2026.
Datum završetka
11.10.2029.
Status
Aktivan
Iznos financiranja
199927 EUR
Više informacija

Rak jajnika (OC) je najsmrtonosnija ginekološka maligna bolest, a najčešći i najmaligniji podtip je serozni rak jajnika visokog gradusa (HGSOC), koji nastaje iz epitela jajovoda (FT) i često se otkrije prekasno. Ljudski mikrobiom je zajednica trilijuna mikroorganizama koji nastanjuju tijelo, a njihova simbioza s organizmom ključna je za održavanje homeostaze, dok disbioza može uzrokovati rak. Odnos između mikrobioma i OC još nije u potpunosti razjašnjen, posebno ne na razini intratumoralnog mikrobioma (onkobioma). Međutim, pokazano je da disbioza crijevnog mikrobioma kod miševa uzrokuje progresiju OC aktiviranjem puta Hedgehog (HHP). Mi smo pokazali da je ekspresija transkripcijskih faktora (TF) GLI, glavnih efektora HHP, smanjena u HGSOC. Nadalje, otkrili smo da su neki geni povezani s urođenim imunitetom ciljni geni TF GLI. Budući da urođena imunost igra ključnu ulogu u zaštiti od bakterija, pretpostavljamo da onkobiom, smanjenjem aktivnosti HHP, slabi urođenu imunost i time pojačava razvoj HGSOC. Cilj ovog projekta je istražiti interakciju između HHP i onkobioma u HGSOC. U svježim uzorcima HGSOC i zdravih FT bakterijski sastav bit će određen sekvenciranjem cijelog gena za 16S rRNA, ljudski i bakterijski transkriptom određen dualnim RNA-sekvenciranjem pokazat će koji su bakterijski geni eksprimirani te ekspresija kojih ljudski gena je promijenjena zbog infekcije, dok će metabolomika pokazati koji bakterijski metaboliti mogu uzrokovati malignu transformaciju stanica FT. U stolici i vaginalnim brisovima testirat će se prisutnost bakterija kako bi se razvili neinvazivni dijagnostički testovi. U arhivskom tkivu HGSOC odredit će se prisutnost bakterija te razina proteina na čiju gensku ekspresiju utječu bakterije, kako bi se otkrili novi prognostički biomarkeri. Konačno, kokultiviranjem stanica FT s bakterijama razjasnit ćemo molekularne mehanizme i stanične učinke. Povezanost između onkobioma, HHP i HGSOC otvara nove mogućnosti za rano otkrivanje i terapijske opcije.