Prijeđite na glavni sadržaj

Strukturna karakterizacija faktora uključenih u popravak unakrsnog vezanja DNA-protein

Tip projekta
Znanstveno-istraživački projekti
Program
Bilateralni slovensko-hrvatski projekti
Financijer
Hrvatska zaklada za znanost
Datum početka
15.10.2020.
Datum završetka
14.10.2023.
Status
Aktivan
Ukupan iznos financiranja projekta
1499500 HRK
Više informacija

Unakrsna veza DNK-protein (eng. DNA-protein crosslink; DPC) je DNK lezija sa štetnim učincima na organizam, uključujući pojavu tumora, preuranjeno starenje i neurodegenerativne bolesti. DPC-i se pojavljuju usred nepovratnog kovalentnog vezanja proteina na DNK i kao takvi narušavaju sve DNK transakcije: replikaciju, transkripciju i popravak. Popravak DPC-a (DPCR) je stoga esencijalan stanični put koji se sve do nedavnih otkrića proteaza Wss1 i SPRTN nije smatrao posebnim putom popravka DNK oštećenja. Trenutno se malo zna o molekularnim mehanizmima i strukturama čimbenika uključenih u DPCR. Do danas, strukturne informacije o DPC-ovima i DPCR čimbenicima ograničene su na fragment koji sadrži aktivno mjesto SPRTN proteaze. Podaci na modelu kvasca ukazuju da SPRTN vjerojatno djeluje s ATP-ovisnom segregazom p97 obitelji AAA, još jednim bitnim proteinom povezanim s DPCR-om. Povrh toga, nedavno smo pronašli novu potencijalnu proteazu, ACRC (syn. GCNA), za koju se pokazalo da je povezana s DPCR-om. Trenutno nedostaju strukturni podaci o interakciji SPRTN-a sa DPC supstratima i p97 segregazom, kao i biokemijski i strukturni podaci o ACRC-u. Cilj nam je (1) okarakterizirati SPRTN:p97 kompleks i pretpostavljenu proteazu ACRC in vitro i in vivo, i (2) riješiti strukture humanih kompleksa SPRTN:DPC i SPRTN:p97 kao i strukturu ACRC proteina. Kompleksi SPRTN-a sa modelnim DPC-om i p97-om biti će rekonstituirani in vitro. Za dobivanje struktura visoke razlučivosti koristiti će se state-of-the-art krio-elektronski mikroskop sa faznom pločom i direktnim detektorom elektrona, dok će se za rješavanje strukture ACRC-a koristiti kristalografija zbog male veličine proteina. Predloženo istraživanje otkriti će mehanizme djelovanja DPCR-a na molekularnoj razini te pridonijeti području razvijanja inhibitora p97-a i SPRTN-a u svrhu liječenja raka i modulacije procesa starenja.

Ova stranica koristi kolačiće. Neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva. Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

Prilagodi postavke
  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.