Prijeđite na glavni sadržaj

Svjetlo na molekulama: istraživanje spregnute elektronske i nuklearne dinamike

Glavni istraživač

Tip projekta
Znanstveno-istraživački projekti
Program
Istraživački projekti
Financijer
Hrvatska zaklada za znanost
Datum početka
15.3.2017.
Datum završetka
14.3.2021.
Status
Završen
Ukupan iznos financiranja projekta
985000 HRK
Više informacija

Mogućnost praćenja elektronskih i strukturnih transformacija kroz koje molekulski sustav prolazi nakon apsorpcije svjetla je dugo sanjani san. Njegovo je ostvarenje moguće samo kombinacijom teorijskih i eksperimentalnih istraživanja. Nove spektroskopijske tehnike temeljene na interakciji s visokofrekventnim zračenjem dopuštaju istraživanje molekulske strukturne dinamike na dosad neviđenoj razini detaljnosti. Posebno se vremenski razlučena fotoelektronska spektroskopija (TRPES) etablirala kao vodeća tehnika u tom polju. Međutim, interpretacija TRPES eksperimenata zahtijeva naprednu razinu teorije. Teorijske metode za računanje TRPES opservabli moraju biti dovoljno točne da se može uspostaviti izravna veza između strukture molekule i eksperimentalne opservable. One također moraju biti efikasne, jer simulacija vremenski razlučenih eksperimenata zahtijeva račune za stotine ili čak za tisuće molekulskih gemoetrija. Ciljevi ovog projekta su (i) poboljšanje numeričke efikasnosti računanja fotoionizacijskih opservabli. Naš cilj je učiniti vrijeme potrebno za računanje vrlo točnih udarnih presjeka i parametara asimetrije usporedivim s vremenom računanja dinamike u pobuđenim stanjima.; (ii) razvoj metoda za pouzdanije simulacije nedijabatske molekulske dinamike. To se prvenstveno odnosi na uključivanje u simulacije nuklearnih kvantnih efekata. Relaksacija pobuđenih stanja u biomolekulama često odvija eliminacijom vodika kojeg simulacije neadijabatske dinamike često “ne vide” . (iii) poboljšanje numeričke efikasnost simulacija neadijabatske molekulske dinamike prijenosom dijela računa na grafičke procesore (GPU). To će nam omogućiti istraživanje dinamike složenih struktura kao što su hidratirane nukleobaze, vertikalno i horizontalno povezane DNA baze. Mišljenja smo da uz korištenje naprednih algoritamskih tehnika ostvarenje sna i nije tako daleko.

Ova stranica koristi kolačiće. Neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva. Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

Prilagodi postavke
  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.