Utjecaj ponavljajućih sekvenci na molekularnu evoluciju i arhitekturu genoma školjkaša

Glavni istraživač

Tip projekta
u tijeku
Program
Istraživački projekti
Financijer
Hrvatska zaklada za znanost
Datum početka
8.12.2025.
Datum završetka
7.12.2028.
Status
Aktivan
Iznos financiranja
199660 EUR
Više informacija

Ponavljajuće sekvence DNA su najzastupljenije komponente svakog eukariotskog genoma. One se dijele na dvije glavne skupine: satelitne DNA (satDNA), koje se sastoje od nizova uzastopno ponovljenih jedinica te transponirajuće elemente (TE), raspršene diljem genoma. SatDNA i TE ključni su graditelji arhitekture genoma i pokretači njegove evolucije, kroz procese koji reorganiziraju ponavljajuće sekvence DNA i mijenjaju njihov broj kopija. ''Mobilom'' (cjelokupni skup TE u genomu) snažno doprinosi plastičnosti eukariotskog genoma, kroz eksplozije TE aktivnosti. Evolucija satDNA prati nekoliko uvriježenih principa poput: organizacije u duge nizove smještene u heterokromatinu, ''model biblioteke'' i koncept ''usklađene evolucije''. Istraživački interes koji obuhvaća sve aspekte biologije školjkaša je brzo-rastući i usmjerava se prema sveobuhvatnim ''omics'' analizama (uključujući satelitomiku i repeatomiku). Naše analize repetitivnih sekvenci kamenica otkrile su nove obrasce i iznimke od kanonskih koncepata, pružajući vrijedne doprinose znanstvenom području biologije repetitivnih DNA. Također, satDNA ovih organizama su pokazale snažnu povezanost s TE. Koristeći različite eksperimentalne i bioinformatičke pristupe, ovaj projekt namjerava istražiti ulogu TE u organizaciji, širenju i evoluciji satDNA nekoliko vrsta kamenica. Bit će ispitan stupanj ''usklađene evolucije'' i uspoređen za samostalne i TE-inkorporirane nizove satDNA, unutar i između vrsta. Bit će istražena razlika u količini i sadržaju heterokromatina te identificiran i uspoređen aktivni dio mobiloma kamenica. Dobiveni rezultati dat će vrijedan doprinos razumijevanju repetitivnih krajolika genoma te njihovog utjecaja na kromosomsku arhitekturu. Istovremeno, komparativna repeatomika pružit će uvid u evolucijske procese i odnose među repetitivnim sekvencama srodnih vrsta.