Molekularno prepoznavanje nukleinskih kiselina i proteina je od temeljne važnosti za život. Male molekule koje selektivno vežu specifične biomakromolekule stoga su vrlo zanimljive ne samo za razumijevanje takvih procesa već i za potencijalne medicinske primjene, kao lijekovi ili obilježavači za biooslikavanje i analitičke svrhe. U posljednjih 5 godina razvili smo u suradnji s našim partnerima niz novih fluorescentnih aminokiselina i oligopeptida koji su prepoznavali različite DNA ili RNA strukture. Također smo pokazali da se ne-kovalentna agregacija kromofora može koristiti za prepoznavanje DNA / RNA. Nedavno smo razvili inhibitore fluorescentnih enzima i nove mitohondrijske specifične fluorescentne markere. U ovom prijedlogu želimo koristiti veliku biblioteku fluorescentnih aminokiselina razvijenih u prethodnom HrZZ projektu (i pripremiti nove poboljšane), kao i naša znanja o agregaciji boja, te dizajnirati i pripremiti multikromoforne peptide s različito kombiniranim kromoforima (npr. FRET parovi) i DNA / RNA / proteinski ciljanim supstituentima. Takvi peptidni sustavi bi poslužili kao višenamjenski obilježavači za simultano obilježavanje (različitim spektrometrijskim odgovorima) nekoliko različitih sekundarnih struktura (npr. raznih ds- ili ss-DNA / RNA sekvenci, proteina). Alternativno, peptidi će biti dizajnirani za visoko selektivnu interakciju s određenim biološkim ciljem (npr. određeni ds- ili ss-DNA/RNA slijed, DPP III enzim ili amiloid-fibrilacijski peptidni slijed). Interakcija s DNA / RNA / proteinima proučavat će se UV / Vis, fluorescencijom, CD / LD spektroskopijom i DSC / ITC mikrokalorimetrijom, MS, NMR, CLSM.Prijedlog je u skladu s ciljevima HrZZ-a: a) suradnja s međunarodno dobro prepoznatim inozemnim znanstvenicima, b) osposobljavanje mladih istraživača u međunarodnom istraživačkom okruženju i c) očekivani rezultati imaju potencijal komercijalizacije kao nove biokemijski obilježavači / ili lijekovi. Troškovi projekta su 994.000,00 kn za 4 godine.