Prijeđite na glavni sadržaj

Objavljen rad u Nucleic Acids Research

21.3.2014.

Znanstvenica IRB-a dr. Ignacija Vlašić iz Laboratorija za evolucijsku genetiku Zavoda za molekularnu biologiju objavila je rad u časopisu Nucleic Acids Research.

Objavljen rad u Nucleic Acids Research

Bakterija Bacillus subtilis poput eukariota posjeduje dva mehanizma popravka dvolančanih lomova u molekuli DNA (dlDNA), mehanizam homologne rekombinacije (HR) i nehomolognog sparivanja lanaca (NHEJ). Vegetativne stanice koje repliciraju molekulu DNA, prvenstveno popravljaju dlDNA lomove mehanizmom HR-a dok se samo mali broj dlDNA lomova popravlja mehanizmom NHEJ-a.

Mehanizam HR ograničen je na stadij staničnog cikusa u kojem je prisutna sestrinska kromatida, npr. kod eukariota S i G2 faza staničnog ciklusa te tijekom bakterijskog vegetativnog rasta kada se replicira molekula DNA. Ukoliko se Bacillus subtilis izloži nutritivnom stresu, npr. izgladnjivanju, započet će niz morfoloških i fizioloških promjena nazvanih sporulacija što za posljedicu ima stvaranje spore.

Spora je metabolički inaktivna tvorba u kojoj se nalazi samo jedna kopija genoma i koja je izuzetno otporna na vanjske uvjete. Vrlo brzo nakon nasađivanja spora na hranjivu podlogu nastupit će proces germinacije, odnosno tranzicija spore u vegetativnu stanicu u kojem započinje metabolizam molekule DNA. S obzirom da spore posjeduju jednu kopiju genoma i preživljenje spora nakon uvođenja dlDNA lomova ovisi o proteinu RecA (ključnom proteinu HR-a), cilj ovog istraživanja bio je razjasniti ulogu proteina HR i NHEJ u otpornosti spora nakon uvođenja dlDNA lomova ili jednolančanih DNA (jlDNA) ureza uslijed izlaganja ionizirajućem zračenju (IR) ili ultra-visokom vakuumu (UHV).

Dvolančani DNA lomovi najopasniji su oblik oštećenja u molekuli DNA koji ukoliko se ne poprave mogu biti smrtonosni za svaku živu stanicu. Kako bi se istražila važnost proteina HR i NHEJ u popravku dlDNA lomova, napravljena je opsežna genetička analiza, a za potrebe in vitro analize rekonstruiran je replisom. In vivo rezultati istraživanja pokazali su da preživljenje spora ovisi o proteinima NHEJ-a koji su uključeni u popravak dlDNA lomova i o proteinima HR-a koji su uključeni u oblikovanje RecA*ssDNA nukleofilamenta. Ujedno, in vitro rezultati pokazali su da protein RecA inhibira DNA replikaciju.

Istraživanje je uvelike doprinijelo razumijevanju mehanizama popravka molekule DNA u bakteriji Bacillus subtilis prilikom procesa germinacije i utvrdilo prisnu povezanost između otpornosti spora, oblikovanja RecA*ssDNA nukleofilamenta i inhibicije DNA replikacije prilikom procesa germinacije.

Kontaktirajte nas

Ova stranica koristi kolačiće

neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva.

Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.