Samostalni odjel za osiguravanje i unaprjeđivanje kvalitete obavlja poslove unutarnjeg osiguravanja i unaprjeđivanja kvalitete u skladu s posebnim pravilnikom, pruža potporu u postupku vanjskog vrednovanja kvalitete znanstvenog instituta te u postupku sklapanja, provedbe i praćenja programskog ugovora, obavlja poslove vezane uz podnošenje izjave o fiskalnoj odgovornosti i upravljanje rizicima, kao i druge poslove iz svoga djelokruga.