Od ideje do kandidata za lijek: što se dogodi kada kemija i HPC rade zajedno

Objavljen članak u "Journal of Molecular Structure": "Thioxo-tetrahydro-pyrimidin-benzenesulfonamide hybrids as potential BRAFV600E inhibitors: experimental, computational and biological evaluations"

6.11.2025.

Objavljen novi znanstveni rad!

Od ideje do kandidata za lijek: što se dogodi kada kemija i HPC rade zajedno

Mutacija BRAFV600E jedan je od najznačajnijih onkogenih čimbenika koji se pojavljuje u melanomu, karcinomu štitnjače, kolorektalnom karcinomu i brojnim drugim malignitetima — čineći oko 90% svih BRAF mutacija.

U našem najnovijem istraživanju dizajniran je i ispitivan niz tijokso–tetrahidro–pirimidin–benzensulfonamidnih spojeva (P01–P16), inspiriran drugom generacijom BRAF inhibitora.

Što smo napravili:

Proveli molekulsko dokiranje i simulacije molekularne dinamike (uz podršku HPC infrastrukture) kako bismo predvidjeli vezanje uz BRAFV600E protein
Ispitali anti-proliferativnu aktivnost na više linija stanica raka
Procijenili kinaznu inhibiciju usmjerenu na BRAFV600E

Ključni rezultati:

Spojevi P09 (MCF-7), P13 (HePG2, TPC-1) i P02 (A375) pokazali su značajnu anti-proliferativnu aktivnost
P14 je pokazao najbolju inhibiciju BRAFV600E kinaze, nadmašivši referentni lijek sorafenib
SAR analiza ukazuje da elektronski akceptorski supstituenti poboljšavaju aktivnost i na staničnoj i enzimatskoj razini

Ovo istraživanje je korak dalje prema računalno vođenom otkrivanju lijekova protiv raka i pokazuje kako HPC ubrzava put od dizajna molekula → biološkog testiranja → potencijalnih terapijskih kandidata.

Pročitajte rad: https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2025.143620

Naslov: Thioxo-tetrahydro-pyrimidin-benzenesulfonamide hybrids as potential BRAFV600E inhibitors: experimental, computational and biological evaluations

Istraživanje je podržala Hrvatska zaklada za znanost (IP-2022-4658), a provedeno je uz pomoć superračunala Supek pri SRCE-u, Sveučilište u Zagrebu.

Znanstveni rad

Thioxo-tetrahydro-pyrimidin-benzenesulfonamide hybrids as potential BRAFV600E inhibitors: experimental, computational and biological evaluations

Pretraži Institut Ruđer Bošković

Od ideje do kandidata za lijek: što se dogodi kada kemija i HPC rade zajedno

Znanstveni rad

Institut Ruđer Bošković

Telefon:

+385 1 4561 111

Od ideje do kandidata za lijek: što se dogodi kada kemija i HPC rade zajedno

Znanstveni rad

Vezane vijesti

CIR je dobio pristup superračunalu Fugaku

CIR Seminar iz računalne znanosti: Distribuirani CholeskyQR za loše kondicionirane matrice

CIR Seminar iz računalne znanosti: Pregled inhibitora 17β-hidroksisteroid dehidrogenaze tipa 1: dokiranje i simulacije molekularne dinamike

EUROCC2 Bilten - Lipanj 2024

EUROCC2 Bilten - Travanj 2024