Prijeđite na glavni sadržaj

Alfa satelitska DNA u evoluciji mreža genske modulacije

Glavni istraživač

Tip projekta
Znanstveno-istraživački projekti
Program
Istraživački projekti
Financijer
Hrvatska zaklada za znanost
Datum početka
1.2.2020.
Datum završetka
31.1.2024.
Status
Aktivan
Ukupan iznos financiranja projekta
1000000 HRK
Više informacija

Satelitske DNA su uzastopno ponovljene sekvence koje se preferencijalno grupiraju unutar konstitutivnog heterokromatina. Međutim, u nekim slučajevima, one su djelomično raspršene u blizini gena unutar eukromatina. Smatra se da su takva mješovita organizacija i uzajamno djelovanje između satelitskih ponavljanja unutar heterokromatina i eukromatina odgovorni za učinak satelitske DNA na modulaciju ekspresije gena koja je prvi put pokazana u kukcu Tribolium castaneum. Primarni cilj predloženog projekta je istražiti ulogu ljudske alfa satelitske DNA u modulaciji genske ekspresije. Alfa satelitska DNA je glavna ljudska satelitska DNA smještena u (peri)centromernim područjima svih ljudskih kromosoma, a zajednička je svim primatima. Pored (peri)centromernog položaja, bioinformatička pretraga ljudskog genoma otkriva alfa satelitska ponavljanja raspršena unutar eukromatina, uz gene, i ukazuje na sličnu genomsku organizaciju glavnog satelita kukca Tribolium castaneum i alfa satelitske DNA. Na temelju ovog zapažanja može se pretpostaviti da alfa satelitski transkripti mogu potaknuti epigenetski mehanizam koji modificira kromatin na raspršenim alfa satelitskim ponavljanjima, što dovodi do promjena u ekspresiji obližnjih gena. Koristeći eksperimentalni pristup, planiramo istražiti utjecaj glavne ljudske alfa satelitske DNA na ekspresiju susjednih gena, kao i molekularni mehanizam njenog modulatornog djelovanja na gene. Osim toga, izvršit će se bioinformatička analiza i usporedba alfa satelitskih ponavljanja raspršenih unutar eukromatina svih sekvenciranih genoma primata kao i karakterizacija njima susjednih gena. Na temelju dobivenih podataka očekujemo da ćemo otkriti moguću ulogu alfa satelitske DNA u fiziologiji i evoluciji mreža genske modulacije u primata.

Ova stranica koristi kolačiće. Neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva. Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

Prilagodi postavke
  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.