Prijeđite na glavni sadržaj
Tip projekta
Znanstveno-istraživački projekti
Program
Istraživački projekti
Financijer
Hrvatska zaklada za znanost
Datum početka
1.3.2017.
Datum završetka
28.2.2021.
Status
Završen
Iznos financiranja
1000000 HRK
Više informacija

Evolucijski životni ciklus gena u genomu pokretan je procesom rađanja i umiranja gena. Mada ovaj mehanizam direktno utječe na sadržaj genoma uzrokujući dobitak i gubitak gena njegova dinamika kroz filogeniju eukariota još je nerazjašnjena. Nastanak i gubitak cijelih genskih obitelji je dodatna razina evolucijskog protoka u genomima koja je česta ali često ignorirana pojava. Za praćenje nastanka i gubitka genskih obitelji moguće je u principu koristiti filostratigrafski pristup. U ovom projektu, predlažemo stvaranje sveobuhvatne i usklađene procjene nastanka i gubitka genskih obitelji kroz filogeniju eukariota koristeći stotine eukariostkih genoma unutar filostratigrafskog okvira. Ovo znanje omogućit će nam procjenu odnosa između stopa nastanka i gubitka genskih obitelji kroz evolucijsko vrijeme i rekonstrukciju sastava genskih obitelji u predačkim genomima. Kako bi ostvarili ove ciljeve razvit ćemo nove algoritme i implementirati nove strategije računanja unutar filostratigrafskog okvira te ćemo ova rješenja učiniti javno dostupna kroz web aplikaciju. Kada katalog nastanka i gubitka gena bude gotov cilj nam je povezati profile nastanka i nestanka gena s evolucijom fenotipova. Osim evolucijske biologije, naša kolekcija nastanka i gubitka genskih obitelji biti će vrijedan izvor informacija za različita područja uključujući komparativnu genomiku, razvojnu biologiju i translacijsku medicinu. Na primjer, biti će moguće pronaći organizme koji su ‘evolucijski nul-mutanti’ za gene povezane s patološkim promjenama kod čovjeka kao i nove gene povezane s bolestima. Osim direktne koristi od publikacija u vodećim časopisima i znanstvenih suradnji uvjereni smo da će ovaj projekt imati značajan utjecaj na trening mladih znanstvenika koje namjeravamo zaposliti na projektu i osposobiti ih za vođenje istraživanja na presjeku evolucijske i računalne biologije.

Ova stranica koristi kolačiće. Neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva. Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

Prilagodi postavke
  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.