Prijeđite na glavni sadržaj

Još jedan vrstan doktorat u CIR-u

6.10.2016.
Još jedan vrstan doktorat u CIR-u

Ivan Sović je završio doktorski studij pod mentorstvom Mile Šikića i Karolja Skale obranom teze 4. listopada 2016. godine na temu "Algoritmi za de novo sastavljanje genoma iz sekvencijskih podataka treće generacije" ("Algorithms for de novo genome assembly from third generation sequencing data") pred povjerenstvom:

Prof dr. sc. Mladen Vučić i  Doc. dr. sc. Mirjana Domazet-Lošo s FER-a, i pred vanjskim članom Dr. sc. Niranjan Nagarajan, znanstvenim savjetnikom s Genome Institute of Singapore.

Rezultati doktorskog rada i istraživanja objavljeni su i dostupni na:

  1. Sović, I., Šikić, M., Wilm, A., Fenlon, S.N., Chen, S., Nagarajan, N., "Fast and sensitive mapping of nanopore sequencing reads with GraphMap", Nature Communications, 7 (2016). http://www.nature.com/articles/ncomms11307
  2. Sović, I., Križanović, K., Skala, K., Šikić, M., “Evaluation of hybrid and non-hybrid methods for de novo assembly of nanopore reads.”, Bioinformatics(Oxford, England), 2016. http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/32/17/2582 http://biorxiv.org/content/early/2015/11/13/030437
  3. Vaser, R., Sović, I., Nagarajan, N., Šikić, M., "Fast and accurate de novo genome assembly from long uncorrected reads". bioRxiv 068122; doi: http://dx.doi.org/10.1101/068122 http://biorxiv.org/content/early/2016/08/05/068122

 

Sve razvijene metode otvorenog su koda i slobodno dostupne na GitHubu:

https://github.com/isovic/graphmap

Čestitke Ivanu!

Ivan Sovic sa mentorima

Ivan Sović sa mentorima: prof. dr. K. Skala i prof. dr. M. Šikić

Ova stranica koristi kolačiće

neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva.

Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.