PhyLoss

Kategorija
Projekti Hrvatske zaklade za znanost
Iznos financiranja
1.000.000,00
HRK
Datum početka
1.3.2017.
Datum završetka
28.2.2021.
Status
Aktivan

HRZZ Istraživački projekti (IP-06-2016) Filostratigrafija nastanka i gubitka gena (PhyLoss)

Evolucijski životni ciklus gena u genomu pokretan je procesom rađanja i umiranja gena. Mada ovaj mehanizam direktno utječe na sadržaj genoma uzrokujući dobitak i gubitak gena njegova dinamika kroz filogeniju eukariota još je nerazjašnjena. Nastanak i gubitak cijelih genskih obitelji je dodatna razina evolucijskog protoka u genomima koja je česta ali i često ignorirana pojava. Za praćenje nastanka i gubitka genskih obitelji moguće je u principu koristiti filostratigrafski pristup. U ovom projektu, predlažemo stvaranje sveobuhvatne i usklađene procjene nastanka i gubitka genskih obitelji kroz filogeniju eukariota koristeći stotine eukariotskih genoma unutar filostratigrafskog okvira. Ovo znanje omogućit će nam procjenu odnosa između stopa nastanka i gubitka genskih obitelji kroz evolucijsko vrijeme i rekonstrukciju sastava genskih obitelji u predačkim genomima. Kako bi ostvarili ove ciljeve razvit ćemo nove algoritme i implementirati nove strategije računanja unutar filostratigrafskog okvira te ćemo ova rješenja učiniti javno dostupna preko weba. Kada katalog nastanka i gubitka gena bude gotov cilj nam je povezati profile nastanka i nestanka gena s evolucijom fenotipova. Osim evolucijske biologije, naša kolekcija nastanka i gubitka genskih obitelji biti će vrijedan izvor informacija za različita područja uključujući komparativnu genomiku, razvojnu biologiju i translacijsku medicinu. Na primjer, biti će moguće pronaći organizme koji su "evolucijski nul-mutanti" za gene povezane s patološkim promjenama kod čovjeka kao i nove gene povezane s bolestima. Uvjereni smo da će ovaj projekt imati značajan utjecaj na trening mladih znanstvenika koje namjeravamo zaposliti na projektu i osposobiti ih za vođenje istraživanja na presjeku evolucijske i računalne biologije.

Ostali suradnici

dr. sc. Željka Pezer Sakač, dr. sc. Martin Sebastijan Šestak, doc. dr. sc. Mirjana Domazet-Lošo,  dr. sc. Momir Futo 

Ova stranica koristi kolačiće

neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva.

Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.