Nedostatak S-adenozilhomocistein hidrolaze (AHCY) ultrarijetka je metabolička bolest otkrivena u Hrvatskoj 2002. godine, a mišićna slabost (miopatija) jedan je od njezinih glavnih kliničkih znakova. Projekt R3forAHCY razvija prvi model te miopatije iz stanica bolesnika i ispituje mogućnost ispravka uzročne mutacije.

Iz stanica bolesnika s nedostatkom AHCY proizvest ćemo inducirane pluripotentne matične stanice (iPSC) i diferencirati ih u mišićne stanice — prvi takav model ove bolesti u svijetu. Na tom modelu provodimo multiomičku analizu: prvo dugolančano sekvenciranje genoma od telomere do telomere (T2T) kod nedostatka AHCY, nativnu metilaciju DNA, sekvenciranje RNA i epigenetičke potpise. Patogenu varijantu ispravljamo metodama uređivanja genoma CRISPR (base i prime editing) i provjeravamo vraća li se time normalna funkcija mišićnih stanica.

Ciljevi

• izrada i validacija iPSC-mioblasta bolesnika te izogenih kontrola ispravljenih CRISPR-om
• prvi multiomički skup podataka za miopatiju uzrokovanu nedostatkom AHCY (T2T dugolančano sekvenciranje, metilacija, RNA-seq)
• ispravak patogene varijante uređivanjem genoma s učinkovitošću većom od 60 %
• funkcijski dokaz popravka fenotipa i mehanistički model bolesti

Suradnja

Copenhagen Neuromuscular Center, Rigshospitalet, Kopenhagen, Danska

Projekt je financirala Hrvatska zaklada za znanost.