Laboratorij za naprednu genomiku ima za cilj omogućiti istraživačkoj zajednici pristup visokoprotočnom sekvenciranju (eng. High Throughput Sequencing, HTS) te ubrzati napredak u području genomskih istraživanja naslanjajući se na integraciju rekombinantne DNA tehnologije, funkcionalne genomike te NGS tehnologije.

LNG

Laboratorij za naprednu genomiku (LNG) razvija i primjenjuje genomske tehnologije za istraživanje bolesti čovjeka i za zdravstvo temeljeno na genomskim podacima. Želimo da Hrvatska u europskom genomskom prostoru ne bude samo korisnik, nego i proizvođač kvalitetnih genomskih podataka.

Što radimo

  • Europska genomska infrastruktura. Sudjelujemo u europskoj inicijativi „1+ milijun genoma” (1+MG). U projektu GDI uspostavili smo hrvatski čvor infrastrukture genomskih podataka, koji je javno dostupan. Kroz projekte B1MGplus i STORE-1PLUSMG pridonosimo pripremi zajedničke europske genomske infrastrukture (Genome EDIC).
  • Genom Europe. Kao hrvatski partner projekta Genome of Europe vodimo hrvatski doprinos europskoj referentnoj bazi genoma, tj. sekvenciranje cijelih genoma hrvatske populacije.
  • Sekvenciranje dugim očitanjima. Uspostavljamo prvu platformu u Hrvatskoj za sekvenciranje cijelog genoma dugim očitanjima (long-read). Duga očitanja otkrivaju strukturne varijante, ponavljajuće sljedove i metilaciju DNA, koje klasične metode često propuštaju. To je ključno za dijagnostiku rijetkih bolesti. Član smo europske mreže ELRIN (European Long Read Innovation Network).
  • Rijetke bolesti. Nedostatak S-adenozilhomocistein-hidrolaze (AHCY) prvi je put otkriven u Hrvatskoj. U projektu R3forAHCY (HRZZ) razvijamo modele bolesti iz induciranih pluripotentnih matičnih stanica i pristupe genskoj terapiji.
  • Od varijante do primjene. Razvijamo metode funkcionalne karakterizacije varijanti nepoznatog značaja (VUS). S industrijskim partnerima razvijamo i farmakogenetičke i nutrigenetičke alate (projekti KZI i IRI S3).

S kim surađujemo

Surađujemo s istraživačima, kliničarima i bolnicama te tvrtkama. Nudimo usluge sekvenciranja i analize genomskih podataka, partnerstva u nacionalnim i europskim projektima i mentorstvo studentima i doktorandima.

Kontakt: dr. sc. Oliver Vugrek, Oliver.Vugrek@irb.hr, +385 1 469 8844

Zaposlenici

V

I

Suradnik na projektu

E

P

Stručni suradnik
voditelj laboratorija znanstveni savjetnik u trajnom izboru

I

Z

Stručni suradnik u sustavu znanosti i visokom obrazovanju