Signalni put Hedgehog povezan je s nastankom raznih tumora, ali točni mehanizmi djelovanje još nisu u potpunosti razjašnjeni. Fokus ovog istraživanja su tumori s mutacijama u genima BRAF ili NRAS, te njihov odgovor na inhibiciju signalnog puta Hedgehog. BRAF i NRAS nekanonički aktiviraju sva tri proteina GLI, ali točan slijed i djelovanje ovih interakcija još nisu razjašnjeni. Ovim projektom planiramo odrediti točne transkripcijske mete proteina GLI1, GLI2 i GLI3 u melanomima s različitim genetičkim podlogama: mutacijom u BRAF, mutacijom u NRAS, ili bez mutacije u ova dva gena. Stoga ćemo prvo provesti analizu ChIP-seq kako bismo odredili točne transkripcijske mete ovih proteina. Nakon toga uklonit ćemo gene za svaki od tih proteina („knock-out“) i sekvencirati transkriptome tih staničnih linija. Nakon izrade „knock-out“ linija, testirat ćemo ih nizom testova kako bismo odredili ulogu svakog od tri proteina GLI u tumorima ovisnim o mutacijama u BRAF/NRAS, te kako bismo razjasnili mehanizam njihovog djelovanja u melanomima. Kombiniranim tretmanima inhibitorima signalnog puta Hedgehog i specifičnim inhibitorima BRAF/NRAS, te izradom i testiranjem staničnih linija otpornih na te lijekove, pokazat ćemo postoji li pozitivan učinak za potencijalno liječenje melanoma. Sve ove analize pokazat će nam mogu li se proteini GLI ili njihovi ciljni geni koristiti kao potencijalni biomarkeri za melanom. Na kraju, u zadnjoj godini projekta, analizom potencijalnih biomarkera na kliničkim uzorcima, procijenit ćemo njihovu moguću primjenu u klinici. Ukratko, ovim projektom u planu je kompletna analiza GLI koda u melanomima ovisnim o BRAF/NRAS mutacijama, od određivanja transkripcijskih meta i pronalaženja molekularnih mehanizama do potencijalne primjene u klinici.

Radovi u časopisima

1. Kurtović, Matea; Piteša, Nikolina; Bartoniček, Nenad; Ozretić, Petar; Musani, Vesna; Čonkaš, Josipa; Petrić, Tina; King, Cecile; Sabol, Maja
RNA-seq and ChIP-seq Identification of Unique and Overlapping Targets of GLI Transcription Factors in Melanoma Cell Lines.  // Cancers, 14 (2022), 18; 4540, 20 doi:10.3390/cancers14184540 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

2. Trnski, Diana; Sabol, Maja; Tomić, Sanja; Štefanac, Ivan; Mrčela, Milanka; Musani, Vesna; Rinčić, Nikolina; Kurtović, Matea; Petrić, Tina; Levanat, Sonja; Ozretić, Petar
SHH-N non-canonically sustains androgen receptor activity in androgen-independent prostate cancer cells.  // Scientific reports, 11 (2021), 1; 14880, 11 doi:10.1038/s41598-021-93971-6 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

3. Zubčić*, Vedran; Rinčić*, Nikolina; Kurtović, Matea; Trnski, Diana; Musani, Vesna; Ozretić, Petar; Levanat, Sonja; Leović, Dinko; Sabol, Maja
GANT61 and Lithium Chloride Inhibit the Growth of Head and Neck Cancer Cell Lines Through the Regulation of GLI3 Processing by GSK3beta.  // International journal of molecular sciences, 21 (2020), 6410, 13 doi:10.3390/ijms21176410 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

Sažeci sa skupova

1. Kurtović, Matea; Piteša, Nikolina; Bartoniček, Nenad; Ozretić, Petar; Musani, Vesna; Petrić, Tina; Čonkaš, Josipa; Sabol, Maja
Unique and overlapping transcriptional targets of GLI1, GLI2 and GLI3 in melanoma cell lines.  // “HDIR-6: Targeting Cancer” The 6th Meeting of the Croatian Association for Cancer Research with International Participation / Ozretić, Petar - Zagreb : Croatian Association for Cancer Research, 2022
Zagreb, Hrvatska, 2022. str. 25-25 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

2. Čonkaš, Josipa; Josić, Janja; Piteša, Nikolina; Kurtović, Matea; Petrić, Tina; Musani, Vesna; Sabol, Maja; Vugrinec, Ozren; Leović, Dinko; Ozretić, Petar
The role of androgen and androgen receptors in metastasis of head and neck tumors.  // 6. simpozij studenata doktorskih studija PMF-a : knjiga sažetaka = 6th Faculty of Science PhD student symposium : book of abstracts / Schneider, Petra (ur.).
Zagreb: Prirodoslovno-matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu, 2022. str. 192-193 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

3. Piteša, N; Kurtović, M; Bartoniček, N; Petrić, T; Čonkaš, J; Musani, V; Ozretić, P; Sabol, M
Hedgehog-GLI and MAPK signalling pathway activity in GANT61-resistant melanoma cells.  // Online abstracts
Seville, Španjolska, 2022. EACR22-0296, 1 (poster, podatak o recenziji nije dostupan, sažetak, ostalo)

4. Piteša, Nikolina; Bartoniček, Nenad; Kurtović, Matea; Petrić, Tina; Čonkaš, Josipa; Musani, Vesna; Ozretić, Petar; Sabol, Maja
Primary cilia - a potential link between hedgehog- GLI and MAPK signaling in GANT61 -resistant  melanoma cell lines.  // Book of Abstracts of the Congress of the Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology HDBMB22: From Science to Knowledge / Dulić, Morana ; Sinčić, Nino ; Vrhovac Madunić Ivana (ur.).
Zagreb: Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology, 2022. str. 119-119 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

5. Čonkaš, Josipa; Josić, Janja; Piteša, Nikolina; Kurtović, Matea; Petrić, Tina; Musani, Vesna; Sabol, Maja; Vugrinec, Ozren; Leović, Dinko; Ozretić, Petar
Membrane androgen receptor OXER1 indicates a potential role in metastasis of head and neck tumors.  // “HDIR-6: Targeting Cancer” - The 6th Meeting of the Croatian Association for Cancer Research with International Participation – Book of Abstracts / Ozretić, Petar (ur.).
Zagreb: Croatian Association for Cancer Research, 2022. str. 36-36 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

6. Piteša, Nikolina; Bartoniček, Nenad; Kurtović, Matea; Petrić, Tina; Čonkaš, Josipa; Musani, Vesna; Ozretić, Petar; Sabol, Maja
Signaling Switch from Hedgehog-GLI to MAPK Potentially Drives Primary Cilia Loss inNRAS Mutated GANT61-Resistant Melanoma Cell Line.  // “HDIR-6: Targeting Cancer” - The 6th Meeting of the Croatian Association for Cancer Research with International Participation – Book of Abstracts / Ozretić, Petar (ur.).
Zagreb: Croatian Association for Cancer Research, Zagreb, Croatia, 2022. str. 45-45 (poster, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

7. Petrić, Tina; Kurtović, Matea; Piteša, Nikolina; Čonkaš, Josipa; Musani, Vesna; Ozretić, Petar; Sabol, Maja
Hedgehog-GLI signaling pathway in 3D model of prostate cancer.  // From Science to Knowledge / Dulić, Morana ; Sinčić, Nino ; Vrhovac Madunić, Ivana (ur.).
Zagreb: HDBMB, 2022. str. 117-117 (poster, sažetak, znanstveni)

8. Petrić, Tina; Kurtović, Matea; Piteša, Nikolina; Čonkaš, Josipa; Musani, Vesna; Ozretić, Petar; Sabol, Maja
3D CULTURE OF PROSTATE CANCER AS A MODEL TO STUDY HEDGEHOG-GLI SIGNALING PATHWAY.  // “HDIR-6: Targeting Cancer” The 6th Meeting of the Croatian Association for Cancer Research with International Participation / Ozretić, Petar (ur.).
Zagreb: Croatian Association for Cancer Research, 2022. str. 44-44 (poster, sažetak, znanstveni)

9. Piteša, Nikolina; Bartoniček, Nenad; Kurtović, Matea; Musani, Vesna; Trnski, Diana; Ozretić, Petar; Sabol, Maja
Genes for competing endogenous RNAs as targets of transcription factors GLI in melanoma cell lines.  // Serbian Association for Cancer Research-5th Congress of SDIR: Translational Potential of Cancer Research in Serbia (Abstract book) / Đorđić Crnogorac, Marija ; Nedeljković, Milica (ur.).
Beograd: Srpsko društvo istraživača raka, 2021. str. 9-9 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

10. Kurtović, Matea; Rinčić, Nikolina; Trnski, Diana; Musani, Vesna; Ozretić, Petar; Sabol, Maja
CRISPR/Cas9 mediated knockout of GLI1, GLI2 and GLI3 genes in melanoma cell lines.  // 45th FEBS Congress Abstracts
Virtualno, 2021. 38528, 1 (poster, sažetak, znanstveni)

11. Križanac, Marinela; Leović, Matko; Rinčić, Nikolina; Trnski, Diana; Musani, Vesna; Ozretić, Petar; Levanat, Sonja; Zubčić, Vedran; Leović, Dinko; Sabol, Maja
Hedgehog-GLI signaling controls proliferation and invasiveness of head and neck squamous cell carcinoma.  // HDBMB2019 Crossroads in Life Sciences / Katalinić, Maja ; Dulić, Morana ; Stuparević, Igor (ur.).
Zagreb: Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology, 2019. str. 115-115 (poster, podatak o recenziji nije dostupan, sažetak, znanstveni)

Druga sudjelovanja na skupovima

1. Petrić, Tina
Let's Go 3D: The Future Of Prostate Cancer Models.  // THE KEMOMIND SCIENCE CONFERENCE / Kokondoska Grgič, Vesna ; Vuga, Andrej (ur.).
Ljubljana: Kemomed d.o.o., 2022. str. 32-32 (predavanje, sažetak, znanstveni)

2. Kurtović, Matea; Bartoniček, Nenad; Piteša, Nikolina; Ozretić, Petar; Musani, Vesna; Petrić, Tina; Čonkaš, Josipa; Sabol, Maja
RNA sequencing reveals unique and overlapping transcriptional targets of GLI1, GLI2 and GLI3 in melanoma cell lines.  // EACR 2022 Congress - Innovative Cancer Science: Translating Biology to Medicine
Sevilla, Španjolska, 2022. (poster, ostalo, znanstveni)

3. Kurtović, Matea; Rinčić, Nikolina; , Trnski, Diana; Musani, Vesna; Ozretić, Petar; Sabol, Maja
Generation of GLI1, GLI2 and GLI3 knock-out melanoma cell lines via CRISPR/Cas9 gene editing.  // EACR 2021 Virtual Congress
Virtual, 2021. EACR21v 0165, 1 (poster, sažetak, znanstveni)

4. Petrić, Tina; Trnski, Diana; Kurtović, Matea; Rinčić, Nikolina; Musani, Vesna; Ozretić, Petar; Sabol, Maja
Hedgehog-GLI signaling pathway in 3D model of prostate cancer.  // Goodbye Flat Biology: Next Generation Cancer Models
Virtual event, 2021. (poster, međunarodna recenzija, neobjavljeni rad, znanstveni)

5. Rinčić, Nikolina; Nenad, Bartoniček; Matea, Kurtović; Vesna, Musani; Diana, Trnski; Petar, Ozretić; Maja, Sabol
GLI transcription targets in melanoma cell lines.  // 45th FEBS Virtual Congress “Molecules of Life: Towards New Horizons“
virtualni kongres, 2021. (poster, recenziran, neobjavljeni rad, znanstveni)

6. Rinčić, Nikolina; Bartoniček, Nenad; Kurtović, Matea; Musani, Vesna; Trnski, Diana; Ozretić, Petar; Sabol, Maja
Specific and overlapping GLI transcription targets in melanoma.  // EACR 2021 : : Innovative Cancer Science
virtualni kongres, 2021. (poster, podatak o recenziji nije dostupan, neobjavljeni rad, znanstveni)

7. Kurtović, Matea; Rinčić, Nikolina; Trnski, Diana; Musani, Vesna; Ozretić, Petar; Sabol, Maja
CRISPR/Cas9 mediated knockout of GLI1, GLI2 and GLI3 genes in melanoma cell lines.  // 20th FEBS Young Scientists´Forum
Virtualno, 2021. 38528, 1 (poster, sažetak, znanstveni)

Ocjenski radovi

1. Piteša, Nikolina. Interakcija signalnih puteva RAS/RAF/MAPK i Hedgehog-GLI u rezistenciji na lijekove u staničnim linijama melanoma čovjeka., 2023., doktorski rad, Sveučilište Josipa Jurja Strossmayera u Osijeku, Osijek (mentor: Maja Sabol)

2. Vučemilo, Nikolina. Uspostava trodimenzionalne sferoidne kulture stanica tumora glave i vrata., 2022., diplomski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet, Biološki odsjek, Zagreb (mentor: Maja Sabol)

3. Brtan, Ana. Karakterizacija i validacija sojeva stanične linije melanoma dobivenih ugradnjom sekvence SHH u genom., 2021., diplomski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet, Biološki odsjek, Zagreb (mentor: Maja Sabol)

4. Čonkaš, Josipa. Konstrukcija vektora za ekspresiju proteina SHH u staničnoj liniji melanoma čovjeka CHL-1., 2021., diplomski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet, Biološki odsjek, Zagreb (mentor: Maja Sabol)

5. Šimatović, Domagoj. Uloga ekspresije p16 u karcinomima glave i vrata., 2021., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb (mentor: Vesna Musani)

6. Rinčić, Nikolina. Izrada "knock out" stanične linije za gen GLI1 primjenom sustava CRISPR/Cas9., 2018., diplomski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet, Biološki odsjek, Zagreb (mentor: Maja Sabol)

Nagrade i priznanja

1. Čonkaš, Josipa: Godišnja nagrada Hrvatske udruge genetičkih inženjera Zoran Zgaga za najbolji diplomski rad u kojemu se primjenjuju metode genetičkog inženjerstva obranjen u akademskoj godini 2020./2021.

2. Rinčić, Nikolina: Godišnja nagrada Instituta Ruđer Bošković u 2020. g. za znanstveni rad pod nazivom "GANT61 and Lithium Chloride Inhibit the Growth of Head and Neck Cancer Cell Lines Through the Regulation of GLI3 Processing by GSK3beta"