Signalni put Hedgehog-GLI (HH-GLI) je važan za embrionalni razvoj, dok je u odraslom organizmu utišan, osim u tkivnim matičnim stanicama. Nepravilna hiperaktivacija ovog signalnog puta dovodi do razvoja mnogih tipova tumora, na način da transkripcijski faktori GLI1, GLI2 i GLI3 kontroliraju ekspresiju gena uključenih u proliferaciju, sposobnost metastaziranja te obnavljanje tumorskih matičnih stanica. U našem prethodnom projektu prvi smo proveli sveobuhvatnu analizu transkripcijskih meta sva tri proteina GLI u melanomima, te identificirali veliki broj prethodno poznatih, ali i novih ciljnih gena.

Ovim projektom želimo ispitati:

1. koji su faktori rasta pod direktnom kontrolom ovog signalnog puta na modelima tumora jajnika, prostate, te glave i vrata,
2. na koji način se signali prenose među stanicama,
3. kako faktori rasta djeluju na stanice tumora i stanice strome,
4. utječe li relativni omjer stanica tumora i stanica strome na ekspresiju gena u te dvije populacije stanica in vitro, te
5. koji je učinak inhibitora HH-GLI i faktora rasta (pojedinačni i kombinirani) na te dvije populacije stanica.

Kako bismo to ispitali koristit ćemo stanične linije, koje ćemo uzgajati u 2D kulturi, ali i u 3D kulturi u obliku sferoida. U oba slučaja također će se koristiti i ko-kulture tumorskih i stromalnih stanica. Rezultati dobiveni tijekom prve tri godine validirat će se na arhivskom materijalu dobivenom iz pacijenata, koji uključuju RNA iz tumora, parafinske rezove, te primarne kulture stanica tumora i strome. Za ispitivanje ovih problema koristit će se niz standardnih molekularno-bioloških metoda (qPCR, Western blot, imunofluorescencija), ali i neke odvedenije metode kao što su hibridizacijski paneli protutijela, RNA-seq te snimanje živih stanica.

Ovim projektom razjasnit će se uloga signalnog puta HH-GLI u komunikaciji između stanica tumora i strome, što bi moglo dovesti do usavršavanja kombinirane terapije tumora te otkrića novih prognostičkih biljega.