RecNewPath – Rekombinacija, popravak DNA i očuvanje integriteta genoma: novi putevi

RecNewPath – Rekombinacija, popravak DNA i očuvanje integriteta genoma: novi putevi

 Inicijacija rekombinacije na dvolančanim krajevima DNA u različitim varijantama RecF puta: uloga različitih nukleaza i helikaza. 

Datum početka projekta
01.09.2014.
Datum kraja projekta
31.08.2018.
Status
Završen
Kategorija projekta
Projekti Hrvatske zaklade za znanost
Šifra projekta
IP-11-2013-2978

Homologna rekombinacija je esencijalan biološki proces koji sudjeluje u popravku DNA i u očuvanju integriteta genoma. Ključnu ulogu u rekombinaciji kod bakterija ima protein RecA, a njegovi homolozi prisutni su i u viših organizama, uključujući čovjeka. Protein RecA djeluje u obliku nukleoproteinskog filamenta koji se formira na jednolančanoj DNA te katalizira sparivanje i izmjenu lanaca između dva homologna dupleksa. U bakteriji Escherichia coli, u sklapanju RecA filamenta sudjeluju proteinski kompleksi RecBCD i RecFOR. Nedavno smo otkrili da neki mutanti bakterije E. coli mogu relativno dobro rekombinirati i u odsutnosti proteinskih kompleksa RecBCD i RecFOR. Ta rekombinacija ovisi o proteinu RecA što ukazuje na postojanje alternativnog mehanizma stvaranja RecA filamenta. Cilj ovog projekta je genetički karakterizirati ovaj RecBCD- RecFOR-neovisan put rekombinacije te rasvjetliti novi mehanizam sklapanja RecA filamenta u bakteriji E. coli.

Iako je protein RecA ključan za rekombinaciju u bakterija, recA mutanti radiorezistentne bakterije Deinococcus radiodurans sposobni su u određenoj mjeri za rekombinacijski popravak dvolančanih lomova DNA. Naši nedavni rezultati pokazali su da je taj RecA-neovisan popravak neprecizan i da dovodi do velikih kromosomskih rearanžmana. U sklopu projekta nastojat ćemo otkriti ključne gene/proteine uključene u RecA-neovisni popravak DNA te karakterizirati, na razini sekvence, velike genomske rearanžmane u bakteriji D. radiodurans.

S obzirom da je rekombinacija fundamentalan proces sačuvan tijekom evolucije, naša istraživanja na bakterijama mogla bi pomoći u rasvjetljavanju rekombinacijskih mehanizama u višim, eukariotskim organizmima. Rezultati ovog projekta mogli bi stoga pomoći i u razumijevanju mehanizama nastanka raka i nasljednih bolesti kod čovjeka koje su povezane s poremećajima u rekombinacijskim procesima.  

Glavni istraživač / voditelj
Davor Zahradka

Davor Zahradka, dr. sc.

viši znanstveni suradnik +385 1 456 0971

Ostali suradnici

Projekt će se realizirati u suradnji dvije istraživačke grupe, Laboratorija za molekularnu mikrobiologiju (LMM, voditelj D. Zahradka) i Laboratorija za molekularnu genetiku (LMG, voditelj D. Vujaklija).

Suradnici LMM:

Ksenija Zahradka, dr.sc. Ksenija.Zahradka@irb.hr

Damir Đermić, dr.sc. dermic@irb.hr

Maja Buljubašić, dr.sc. mbuljub@irb.hr  (do 30.06.2015.)

Jelena Repar, dr.sc. jrepar@irb.hr

Svjetlana Cvjetan, dr.sc. scvjetan@irb.hr

Ana Hlevnjak, mag.mol. biotehnol. Ana.Hlevnjak@irb.hr (od 07.01.2015.)

 

Suradnici LMG:

Dušica Vujaklija, dr.sc. vujaklij@irb.hr

Tina Paradžik, dr.sc. tsimunov@irb.hr

Želimira Filić, prof.biol. Zelimira.Filic@irb.hr

 

Konzultant:

Prof. Miroslav Radman, Faculté de Médecine, Université R. Descartes, Paris, France & Mediterranean Institute for Life Sciences, Split, Croatia 

Ova stranica koristi kolačiće

Neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva.

Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.