Prijeđite na glavni sadržaj

Genetičari s IRB-a identificirali su prisutnost omikron varijante koronavirusa

6.12.2021.

Znanstveni tim Laboratorija za naprednu genomiku Instituta Ruđer Bošković (IRB), pod vodstvom dr. sc. Olivera Vugreka, identificirao je prisutnost omikron varijante u Hrvatskoj. Naime, ciljano sekvenciranje SARS-CoV-2 pozitivnog uzorka potvrdilo je ključne mutacije koji su prisutne u omikorn varijanti koronavirusa B.1.1.529.

Genetičari s IRB-a identificirali su prisutnost omikron varijante koronavirusa

Potencijalno pozitivan uzorak na prisutnost virusa SARS-CoV-2 prikupila je 1. prosinca 2021. godine Poliklinika Medikol u sklopu PCR testiranja.

Osoba koja je pristupila testiranju izrazila je sumnju na mogućnost zaraze novom varijantom koronavirusa omikron, zbog ostvarenog kontakta s osobom iz Južnoafričke Republike.

Njenom je privolom uzorak upućen u daljnju obradu u Laboratorij za naprednu genomiku IRB-a.

''RT-PCR analiza prikupljenog uzorka ukazala je na određena odstupanja u odnosu na dosadašnje analizirane uzorke. Sekvenciranjem ključnih regija izoliranog SARS-CoV-2 genoma dokazana je prisutnost mutacija karakterističnih za novu varijantu SARS-CoV-2 omikron. Analizirano je sveukupno 28 mutacija u proteinu S (Spike) te 6 mutacija u proteinu N (nukleokapsidni protein). Sve analizirane mutacije identificirane su u prikupljenom uzorku sa stopostotnim podudaranjem,'' objašnjava dr. Vugrek

Detektirane mutacije:

  • S: A67V, H69-, V70-, T95I, G142-, V143-, Y144-, Y145D, N211-, L212I, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, H655Y, N679K, P681H, Q954H, N969K, L981F
  • N: P13L, E31-, R32-, S33-, R203K, G204R

U pripremi uzorka za sekvenciranje sudjelovali su doktorandi Filip Rokić i Ena Šimunić, te stručna suradnica Silvia Mohorić, dr. med. Uzorci su sekvencirani na instrumentu ABI Prism 3100, u suradnji s dr. sc. Helenom Ćetković, voditeljicom Laboratorija za molekularnu genetiku i članicom laboratorija dr. sc. Nikolinom Škrobot Vidaček. Sekvence SARS-CoV-2 omikron analizirao je dr. sc. Oliver Vugrek.

Institut je o ovim rezultatima obavijestio Hrvatski zavod za javno zdravstvo i Ministarstvo zdravstva koji su danas potvrdili ove rezulte te obavijestili javnost.

Kontaktirajte nas

Više informacija

O

V

Oliver Vugrek

dr. sc. , Voditelj laboratorija znanstveni savjetnik
Tel:
+385 1 457 1381
Mob: 091/468-0778
Interni broj:
1649

Ova stranica koristi kolačiće

neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva.

Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.