Prijeđite na glavni sadržaj

Istraživanje uloge proteinske modifikacije ADP-ribozilacije kod bakterija

Glavni istraživač

Kategorija
Projekti Hrvatske zaklade za znanost
Šifra projekta
IP-20106-06-4242
Iznos financiranja
1.000.000,00
HRK
Datum početka
1.3.2017.
Datum završetka
28.2.2021.
Status
Aktivan

Zavod za molekularnu biologiju

Istraživanje uloge proteinske modifikacije ADP-ribozilacije kod bakterija
A
A
A

Sažetak projekta

Post-translacijske modifikacije događaju se nakon biosinteze proteina, mijenjaju svojstva proteina te proširuju njihov funkcionalni repertoar i regulaciju. ADP-ribozilacija proteina je reverzibilna post-translacijska modifikacija u kojoj se adenozin difosfat (ADP)-ribozni dio iz nikotinamid-adenin-dinukleotida (NAD) prenosi na ciljni protein. To je evolucijski očuvan proces koji kontrolira važne stanične procese kod eukariota. ADP-ribozilacija je otkrivena i kod nekoliko vrsta bakterija, ali su njezina regulacija i fiziološka važnost kod bakterija vrlo slabo istražene. Trenutno dostupni podaci ukazuju na to da ADP-ribozilacija sudjeluje u regulaciji proizvodnje antibiotika u modelnoj bakteriji iz roda Streptomyces, S. coelicolor. Streptomiceti su uobičajene bakterije tla poznate kao glavni proizvođači velikog broja različitih prirodnih bioaktivnih spojeva, posebno antibiotika.
U okviru ovog projekta ćemo identificirati i opisati proteine odgovorne za stavljanje i skidanje proteinske modifikacije ADP-ribozilacije kod bakterije S. coelicolor i razjasniti stanične i metaboličke puteve koje ova modifikacija kontrolira. Razumijevanje procesa ADP-ribozilacije kod streptomiceta trebalo bi nam omogućiti bolju manipulaciju i kontrolu metabolizma kod ovih iznimno važnih industrijskih mikroorganizama. Zbog očuvanosti proteina uključenih u proces ADP-ribozilacije, nove spoznaje do kojih dođemo kroz ovaj projekt moći će se primijeniti i na druge bakterijske vrste, a u nekim aspektima potencijalno i na ljude.

Publikacije

Munnur D, Bartlett E, Mikolčević P, Kirby IT, Matthias Rack JG, Mikoč A, Cohen MS, Ahel I. Reversible ADP-ribosylation of RNA. Nucleic Acids Res. 47 (2019) 5658-5669. 

Palazzo L, Mikolčević P, Mikoč A, Ahel I. ADP-ribosylation signalling and human disease. Open Biol. 9 (2019) 190041. 

Agnew T, Munnur D, Crawford K, Palazzo L, Mikoč A, Ahel I. MacroD1 Is a Promiscuous ADP-Ribosyl Hydrolase Localized to Mitochondria. Front Microbiol. 9 (2018) 20.

Crawford K, Bonfiglio JJ, Mikoč A, Matic I, Ahel I. Specificity of reversible ADP-ribosylation and regulation of cellular processes. Crit Rev Biochem Mol Biol. 53 (2018) 64-82.

Palazzo L, Mikoč A, Ahel I. ADP-ribosylation: new facets of an ancient modification. FEBS J. 284 (2017) 2932-2946.

Konferencije

PARP 2019 (20-23. 05. 2019., Budimpešta, Mađarska):
Petra Mikolčević, Andrea Hloušek-Kasun, Deeksha Munnur, Edward Bartlett, Ilsa T. Kirby, Johannes Rack, Michael S. Cohen, Ivan Ahel, Andreja Mikoč: RNA – a novel substrate of bacterial ADP-ribosyltransferases (poster)

PARP 2019 (20-23. 05. 2019., Budimpešta, Mađarska):
Andrea Hloušek-Kasun, Petra Mikolčević, Gytis Jankevicius, Callum Tromans-Coia, Igor Sabljić, Branimir Bertoša, Ivan Ahel, Andreja Mikoč: Macrodomain protein from Streptomyces coelicolor - SCO6735 reverses T-linked DNA ADP-ribosylation (poster)

Hot Topics in Contemporary Crystallography-HTCC4: Structural biology (01-06. 10. 2019., Dubrovnik):
Andrea Hloušek-Kasun, Petra Mikolčević, Igor Sabljić, Branimir Bertoša, Ivan Ahel, Andreja Mikoč: The structure of ADP-ribosyltransferase SCO3734 from bacterium Streptomyces coelicolor (poster)

3rd International Conference on Post Translational Modifications in Bacteria" (3-4. 12. 2018. Tübingen, Njemačka):
Petra Mikolčević, Andrea Hloušek-Kasun, Igor Sabljić, Gytis Jankevicius, Marija Luić, Helena Ćetković, Ivan Ahel, Andreja Mikoč: Ins and Outs of ADP-ribosylation in Streptomyces coelicolor (predavanje)

Ostali suradnici

Dr. sc. Helena Ćetković, Institut Ruđer Bošković
Dr. sc. Matija Harcet, Institut Ruđer Bošković (do ožujka 2020.)
Dr. sc. Mirna Halasz, Institut Ruđer Bošković
Dr. sc. Bruna Pleše, Institut Ruđer Bošković (do rujna 2019.)
Dr. sc. Ivan Ahel, Sveučilište u Oxfordu, UK
Dr. sc. Petra Mikolčević, Institut Ruđer Bošković (HRZZ 2017-2019, Horizon 2020-Widening Fellowship 2019-2021)
Andrea Hloušek-Kasun, mag. mol. biol., Institut Ruđer Bošković (od srpnja 2018.)

Konzultant:
Dr. sc. Dušica Vujaklija, Institut Ruđer Bošković

Ova stranica koristi kolačiće

neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva.

Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.