Hrvatski čvor infrastrukture genomskih podataka (GDI) javno je dostupan
7.10.2026.
Hrvatski čvor europske infrastrukture genomskih podataka (GDI), koji vodi Laboratorij za naprednu genomiku IRB-a, javno je dostupan: dva Beacona i FAIR Data Point.
U sklopu projekta GDI Laboratorij za naprednu genomiku uspostavio je hrvatski čvor europske infrastrukture genomskih podataka. Čvor radi na standardima GA4GH Beacon v2 i FAIR, a pristupom upravlja preko europske prijave LS-AAI i sustava REMS. Javno su dostupni:
- Beacon učestalosti alela – web-sučelje za pretraživanje varijanti: af-beacon.gdi-croatia-node.org
- Beacon na razini ispitanika (API): gdi-croatia-node.org/api – pojedinačni zapisi samo za prijavljene korisnike s odobrenim pristupom
- FAIR Data Point – metapodaci čvora: gdi-croatia-node.org
Čvor trenutačno poslužuje sintetički testni skup podataka inicijative 1+MG (COVID-19) s oko 84,7 milijuna zapisa varijanti. Stvarni podaci nisu učitani. Sljedeći su koraci uključivanje u europsku mrežu Beacona i učitavanje podataka iz projekta Genome of Europe.
Više o projektu: GDI – Genomic Data Infrastructure