Prijeđite na glavni sadržaj

Interakcija dipeptidil peptidaze III s proteinom SH2 domain-containing protein 3C – moguća veza između odgovora na oksidativni stres i stanične migracije

Glavni istraživač

Kategorija
Projekti Hrvatske zaklade za znanost
Šifra projekta
HRZZ IP-2020-02
Ukupan iznos financiranja projekta
971.000
HRK
Datum početka
1.3.2021.
Datum završetka
28.2.2025.
Status
Aktivan
Interakcija dipeptidil peptidaze III s proteinom SH2 domain-containing protein 3C – moguća veza između odgovora na oksidativni stres i stanične migracije

Dipeptidil peptidaza III (DPP III) je cink-ovisna metalopeptidaza koja uzastopno odcjepljuje dipeptide s amino-kraja 3 do 10 aminokiselina dugih peptida te je široko rasprostranjena u organizmima od bakterija do ljudi. Smatra se da ima ulogu u završnim stadijima proteinskog metabolizma u stanici te u regulaciji krvnog tlaka i boli. DPP III je također uključena u regulaciju Nrf2/KEAP1 signalnog puta kroz kompetitivno vezanje na protein KEAP1 koje dovodi do oslobađanja transkripcijskog faktora Nrf2 i aktivacije odgovora na oksidativni stres. U potrazi za drugim proteinskim interaktorima DPP III, pomoću SILAC-MS metode, identificiran je protein SH2 domain-containing protein 3C (SH2D3C) kao potencijalni interaktor. Interakcija je potvrđena na prekomjerno eksprimiranim proteinima korištenjem nekoliko biokemijskih metoda. SH2D3C je jedan od tri člana proteinske NSP obitelji koji sadrže domenu SH2, RasGEF sličnu domenu te regiju bogatu prolinima i serinima između tih dviju domena. SH2D3C i ostala dva člana porodice (SH2D3A and BCAR3) djeluju kao adaptorski i konstrukcijski proteini koji kontroliraju migraciju stanica integriranjem prijenosa signala preko faktora rasta i integrina, ali precizni način njihovog djelovanja još uvijek je nepoznat. U predloženom istraživanju planiramo potvrditi interakciju na endogenim proteinima, utjecaj svakog od proteina na stanične procese u kojima sudjeluju prekomjernom ekspresijom proteina te izbacivanjem (engl. knock out) gena, odrediti afinitet vezanja pomoću biofizičkih metoda te predvidjeti mjesta vezanja molekulskim modeliranjem. Rezultati predloženog istraživanja omogućit će bolje razumijevanje uloge DPP III u signalnim putevima u koje je uključen SH2D3C i obratno. Imajući u vidu da su kontrola migracije stanica i signalni put Nrf2/KEAP1 često narušeni u raku, rezultati predloženog istraživanja mogli bi otvoriti nove mogućnosti za detekciju biomarkera i liječenje raka.

SUDJELOVANJE NA SKUPOVIMA

Mihaela Matovina sudjelovala na 45th FEBS Congress, 03.-08.07.2021. Virtualno/Ljubljana, Slovenija, postersko priopćenje
Ana Tomašić Paić, Lea Barbarić i Mihaela Matovina sudjelovale na Radionici iz Preparativne kromatografije ionske izmjene, 16.-17.12.2021., BioCentar, Zagreb.
Mihaela Matovina sudjelovala na konferenciji The 25th IUBMB Congress, the 46th FEBS Congress and the 15th PABMB Congress (The Biochemistry Global Summit), 9.-14.7.2022., Lisabon, Portugal, postersko priopćenje
Mihaela Matovina i Lea Barbarić sudjelovale na konferenciji International Congress of the Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology HDBMB22: FROM SCIENCE TO KNOWLEDGE, 28.09.-01.10.2022., Brela, Hrvatska, postersko priopćenje MM, postersko priopćenje LB
Lea Barbarić sudjelovala na EMBL radionici "Protein quality control in downstream processes", 29.11.-02.12.2022., Heidelberg, Njemačka. Radionica se sastojala od kratkih predavanja na temu proizvodnje i kontrole kvalitete proteina korištenjem biofizikalnih tehnika poput DSL-a, MST-a, ITC-a, SEC-MALS-a, nanoDSF-a, cryo-EM-a, i sl. Održani su i laboratorijski praktikumi u svrhu dobivanja praktičnog iskustva s navedenim tehnikama na vlastitim uzorcima.
Ana Tomašić Paić sudjelovala na 4th ISFMS—Biochemistry, Molecular Biology and Druggability of Proteins (ISFMS2022), 06.-09.09.2022., Firenca, Italija, postersko priopćenje

SURADNICI

Antonija Tomić, dr.sc.

Znanstveni suradnik
Tel:
+385 1 457 1251
Interni broj:
1265

Ana Tomašić Paić, dr.sc.

Viši stručni suradnik
Interni broj:
1205

Sara Matić, dr.sc.

S

M

Lucija Horvat

L

H

Viši stručni suradnik
Interni broj:
1263

Koraljka Husnjak

Ova stranica koristi kolačiće. Neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva. Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

Prilagodi postavke
  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.