dr. sc. Oliver Vugrek
Bijenicka 46
10000 Zagreb
Hrvatska
Obrazovanje
1997-1999 Postdok, Australsko Nacionalno Sveučilište (ANU), RSBS, Canberra, Australija.
1996 Postdok, Max-Planck-Institut za Staničnu Biologiju, Heidelberg, Njemačka
1995 Doktorat znanosti (dr. rer. nat; magna cum laude), Ruprechts Karl Sveučilište, Heidelberg, Njemačka,
1992 Diploma iz Biologije, Albert Einstein Sveučilište, Ulm, Njemačka,
1985 Matura (Abitur), Friedrich-Schiller-Gymnasium Marbach, Njemačka,
Istaknuti projekti
2025-2028: EASIGEN-DS Design study for a European infrastructure on advanced genomics technologies (Proposal ID 101187908). HORIZON-INFRA-2024-DEV-01. Proračun 3M EUR (IRB udio 70.000,00 EUR).
2024-2028: GOE - Genome of Europe. DIGITAL-2023-CLOUD-AI-04-GENOME (Broj ugovora: 101168231). Početak projekta 1.10.2024 (do 1.4.2028). Proračun 40M EUR (IRB udio 610.000,00 EUR).
2024-2025: NPOO 'Dokazivanje inovativnog koncepta - Drugi Poziv', C3.2.R3-I1.05 projekt "Dokazivanje inovativnog koncepta za karakterizaciju genskih varijanti nepoznatog značaja (VUS)". Proračun 66.000,00 EUR.
2022-2026: GDI - Genomic Data Infrastructure (https://gdi.onemilliongenomes.eu). DIGITAL-2021-CLOUD-AI-01-FEI-DS-GENOMICS. (Broj ugovora: 101081813). Početak projekta 1.11.2022 (do 31.12.2026). Proračun 40M EUR (IRB udio 202.000,00 EUR).
2019-2023: HRZZ IP IP-2018-01-5632: Molekularni aspekti patogenih procesa u AHCY deficijenciji (HRZZ); ugovorena sredstva 985.340,48 HRK
2019-2022: Centar kompetencija u molekularnoj dijagnostici (KK.01.2.2.03.0006) (CEKOM); ugovorena sredstva 2.204.739,05 HRK.
2018-2020: Integrirani test za identifikaciju genetskih promjena koje uzrokuju neplodnost (Genom-IGT)“ ; dr.sc. Oliver Vugrek, u statusu partnera na projektu. Ukupno ugovorena sredstva: 928.819,30 HRK. Vrijeme trajanja 31.05.2018. do 30.05.2020.
2013-2016: FP7-REGPOT-2012-2013-1 Koordinator projekta – ‘Enhancement of the Innovation Potential in SEE through new Molecular Solutions in Research and Development’ Broj ugovora: 316289 (početak projekta 1.6.2013; EUR 4,738,978).
2010-2012 Voditelj projekta: 'Creation of research related infrastructure for Translational Medicine and Applied Genomics' u okviru Science and Innovation Investment Fund Grant scheme (IPA2007/HR/16IPO/001-0403).
2009-2011 Voditelj međunarodnog znanstvenoistraživačkog projekta: Molekularna dinamika S-Adenozilhomocystein hidrolaze (SAHH) i uloga u regulacije genske ekspresije’(br 03-1209/1-2009) u okviru hrvatsko – izraelske suradnje.
2007-2011 Voditelj projekta Nedostatak Adenozilhomocistein hidrolaze: Molekularni mehanizmi novog oboljenja; 098-0000000-2463;
Projekti
-
Genome of Europe- GoE
12.06.2026 - 11.06.2031
-
Molekularni mehanizam aktivacije dsRNA senzora i njihove ADAR1-posredovane inhibicije kod HSV-1 infekcije - HSVdsRNA-IJ
15.12.2025 - 14.12.2028 | 196 535,00 EUR
-
Design Study for a European Infrastructure on Advanced Genomics Technologies - EASIGEN-DS
01.02.2025 - 31.01.2028 | 2 999 266,00 EUR
-
Dokazivanje inovativnog koncepta za karakterizaciju genskih varijanti nepoznatog značaja - VUS
21.01.2025 - 20.01.2026 | 66 000,00 EUR
-
Genome of Europe - GoE
01.10.2024 - 31.03.2028 | 45 000 000,00 EUR
-
Infrastruktura genomskih podataka (GDI) - GDI
01.11.2022 - 31.12.2026 | 40 000 000,00 EUR
-
Molekularni aspekti patogenih procesa u AHCY deficijenciji - DOK - MAPinAD
10.03.2021 - 15.05.2026
-
Molekularni aspekti patogenih procesa u AHCY deficijenciji - DOK - MAPinAD
05.06.2019 - 05.12.2023
-
Molekularni aspekti patogenih procesa u AHCY deficijenciji - MAPinAD
30.04.2019 - 29.10.2023 | 130 777,16 EUR
-
Integrirani test za identifikaciju genetskih promjena koje uzrokuju neplodnost - Genom-IGT
31.05.2018 - 30.06.2021 | 1 244 880,88 HRK
-
Centar kompetencija u molekularnoj dijagnostici - CEKOM
01.04.2018 - 08.11.2022 | 53 179 363,28 HRK
-
Poboljšanje inovacijskog potencijala u jugoistočnoj Europi kroz molekularna rješenja u istraživanju i razvoju - INNOMOL
01.06.2013 - 30.11.2016 | 5 313 649,00 EUR
-
Becoming entrepreneurial: Knowledge transfer from the University of Rijeka Faculty of Medicine to the biotechnology business sector
20.04.2013 - 19.04.2015 | 517 649,99 EUR
-
Molekularna dinamika S-Adenozilhomocistein hidrolaze (SAHH) i uloga u regulaciji genske expresije
01.01.2009 - 31.12.2010 | 50 000,00 USD
-
Nedostatak Adenozilhomocistein hidrolaze: Molekularni mehanizmi novog oboljenja
01.01.2007 - 01.01.2009
Nagrade i priznanja
Godišnja nagrada Instituta Rudjer Bošković za 2010. godinu
Nastava
2003-2011 Nastava na Medicinskom fakultetu Zagreb, Poslijediplomski kolegij
Voditelj kolegija:
Od bolesti do gena – od gena do funkcije: uloga rekombinantnih proteina u funkcionalnoj genomici
Translacijska Medicina – Od bolesti do gena
2008-2011 Nastava na PMFu Zagreb, Poslijediplomski kolegij; Voditelj kolegija: 'omics' metode: Primjena pri rasvijetlavanja novih oboljenja
Istaknute publikacije
- Whittington A T, Vugrek O, Wei K, Hasenbein N G, Sugimoto K, Rashbrooke M C, Wasteneys G O: MOR1 is essential for organizing cortical microtubules in plants. Nature 2001, 411: 610-613.
- Barić I, Fumić K, Glenn B, Ćuk M, Schulze A, Finkelstein J D, Jill James S, Mejaški-Bošnjak V, Pažanin L, Pogribny I P, Radoš M, Sarnavka V, Šćukanec-Špoljar M, Allen R H, Stabler S, Uzelac L, Vugrek O, Wagner C, Zeisel S, Mudd H: S-adenosylhomocysteine hydrolase deficiency in a human: A genetic disorder of methionine metabolism. PNAS USA 2004, 101(12): 4234-4239.
- Vugrek O, Belužić R, Nakić N, Mudd SH: S-Adenosylhomocysteine hydrolase (AHCY) deficiency: Two novel mutations with lethal outcome. Human Mutation, 2009: 30 (4): E555-E565.
- Grbeša, I., Kalo, A., Belužić, R., Kovačević, L., Lepur, A., Rokić, F., Hochberg, H., Kanter, I., Simunović, V., Muńoz-Torres, P.M,. Shav-Tal Y., Vugrek, O (2017). Mutations in S-adenosylhomocysteine hydrolase (AHCY) effect its nucleocytoplasmic distribution and capabilities for interaction with S-adenosylhomocysteine hydrolase-like 1 protein. European Journal of Cell Biology, 96(6):579-590. doi: 10.1016/j.ejcb.2017.05.002.
- Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020. Eurosurveillance Euro Surveill. 2020;25(32); https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410.
- Pavičić, I., Rokić, F., Vugrek, O. (2023). Effects of S-Adenosylhomocysteine Hydrolase Downregulation on WNT Signaling Pathway in SW480 Cells, International Journal of Molecular Sciences. 24, no.22:16102, 2023. https://doi.org/10.3390/ijms242216102.
Publikacije - Uredničke knjige
Zbornik sažetaka s konferencije
-
Game of Epigenomics Conference - Book of Abstracts / Vugrek, Oliver; Jerić, Ivanka; Ambriović Ristov, Andreja et al. (ur.). Zagreb: Ruđer Bošković Institute, 2016
goe.irb.hr
Publikacije - prilozi sa skupa (u časopisu)
Sažetak izlaganja sa skupa
-
Marić, Tihana; Barišić, Antun; Murphy, Mark W.; Logara Klarić, Monika; Žunić, Lucija; Merkler, Ana; Ježek, Davor; Vugrek, Oliver; Belužić, Robert; Bertoša, Branimir et al. | A novel heterozygous variant in the DNA binding DM domain of the DMRT1 associated with Sertoli cell-only syndrome // European journal of human genetics, 31, S1, 2023. str. 94-94. doi: 10.1038/s41431-023-01339-3
doiwww.nature.com -
Logara Klarić, Monika ; Trgovec-Greif, Lovro ; Žunić, Lucija ; Rokić, Filip ; Vičić, Ana ; Marić, Tihana ; Merkler, Ana ; Katušić Bojanac, Ana ; Belužić, Robert ; Stipoljev, Feodora et al. | Genetic analysis of azoospermic men by an integrated NGS panel // European journal of human genetics, 30, 2022. str. 90-90
www.nature.com -
Šutić, Maja; Fitzner, Antje; Bubanović, Gordana; Linke, Matthias; Lepur, Adriana; Kovačević, Lucija; Brčić, Luka; Seiwerth, Sven; Samaržija, Miroslav; Vugrek, Oliver et al. | Reduced promoter methyilation of MyD88 and ASC/TMS1 genes in tumor tissue of patients with lung carcinoma // Libri oncologici : Croatian journal of oncology, 44, 1, 2016. str. 51-51
hrcak.srce.hr Kovačević, Lucija ; Lepur, Adriana ; Grbeša, Ivana ; Belužić, Robert ; Vugrek, Oliver | „Omics“-approach to investigate cancer associated phenotypic changes in Hep G2 cells after targeted silencing of AHCY hydrolase // Libri oncologici : Croatian journal of oncology, 44, 2016. str. 40-40
-
Grbeša, Ivana ; Kovačević, Lucija ; Belužić, Robert ; Lepur, Adriana ; Knežević, Jelena ; Trmčić Cvitaš, Jelena ; Munoz Torres, Pau Marc ; Vugrek, Oliver | IRBIT, a Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor (IP3R) binding protein specifically binds to and inactivates S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase // The FEBS journal, 281, S1, 2014. str. 577-577
febs.onlinelibrary.wiley.com -
Barić, Ivo ; Ćuk, Mario ; Petković-Ramadža, Danijela ; Bilić, Karmen ; Zibar, Karin ; Sarnavka, Vladimir ; Vugrek, Oliver ; Burlina, A. ; Mudd, S.H. ; Fumić, Ksenija | S-adenosylhomocysteine hydrolase deficiency- a review of nine patients // Molecular genetics and metabolism, 2012. str. 303-303
www.sciencedirect.com -
Barić, Ivo ; Ćuk, Mario ; Petković-Ramadža, Danijela ; Bilić, Karlo ; Martinac, I. ; Sarnavka, Vladimir ; Vugrek, Oliver ; Mudd, S.H. ; Fumić, Ksenija | S-adenosylhomocysteine hydrolase deficiency : a natural model for study of various neurological problems in children with possible dysmethylation pathogenesis // European journal of paediatric neurology, 2011. str. S27-S27
www.ejpn-journal.com Belužić, Robert ; Ćuk, Mario ; Pavkov, Tea ; Barić, Ivo ; Vugrek, Oliver | Functional analysis of recombinant mutant A89V S-adenosylhomocysteine hydrolase (AdoHcyase) detected ina AdoHcyase deficient patient. // Clinical chemistry and laboratory medicine, 2007. str. A20-A20
Ćuk, Mario ; Lovrić, Mila ; Fumić, Ksenija ; Mudd, S. Harvey ; Vugrek, Oliver ; Sarnavka, Vladimir ; Barić, Ivo | The fourth S-adenosylhomocysteine hydrolase deficient patient : Further evidence of congenital miopathy // Clinical chemistry and laboratory medicine, 2007. str. 43-43
Barić, Ivo ; Fumić, Ksenija ; Vugrek, Oliver ; Ćuk, Mario ; Maradin, Miljenka, Glenn, Byron ; Wagner, Conrad ; Stabler, Sally ; Schulze, Andreas ; Radoš, Marko ; Sarnavka, Vladimir et al. | S-Adenosylhomocysteine (AdoHcy) hydrolase deficiency: myopathy seems to be congenital // Journal of inherited metabolic disease, 2005. str. 76-76-x
Barić, Ivo ; Glenn, B. ; Fumić, Ksenija ; Ćuk, Mario ; James, S.J. ; Pažanin, Leo ; Radoš, Marko ; Sarnavka, Vladimir ; Schulze, A. ; Šćukanec-Špoljar, Mira et al. | S-Adenosylhomocysteine (AdoHcy) hydrolase deficiency: First proven case in a human // Journal of inherited metabolic disease, 2003. str. 62-62-x
Publikacije - ocjenski radovi
Diplomski rad (sveučilišni)
Mirjana Polović | Obogaćivanje posredovano MBD1 metilirane DNA iz staničnih linija s nedostatnom aktivnosti S-adenozilhomocistein hidrolaze (AHCY) / Oliver Vugrek, Vlatka Zoldoš (mentor). | Zagreb, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2013
Selmani, Atiđa | Prolazna ekspresija varijanti s-adenozilhomocistein-hidrolaze / Vugrek, Oliver (mentor). | Zagreb, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2007
Regović, Maja | STVARANJE STABILNO TRANSFECIRANIH EUKARIOTSKIH STANICA HELA ZA PREKOMJERNU EKSPRESIJU ENZIMA S-Adenozilhomocistein hidrolaze / Vugrek, Oliver (mentor). | Zagreb, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2007
Mijić, Ivana | Preparation and functional analysis of human S- adenosylhomocysteine hydrolase (SAHH) isofroms SAHH-2 and SAHH-3 / Weygand-Đurešević , Ivana (mentor); Vugrek, Oliver (neposredni voditelj) . | Zagreb, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2006
Doktorski rad
Lucija Kovačević | Nedostatak S-Adenozilhomocistein hidrolaze: Molekularni mehanizmi novog oboljenja / Oliver Vugrek (mentor); Igor Jurak (neposredni voditelj) . | Rijeka, Sveučilište u Rijeci, Fakultet biotehnologije i razvoja lijekova, 2017
Belužić, Robert | Nedostatak Aktivnost S-Adenozilhomocistein- Hidrolaze: Molekularna podloga novog nasljednog oboljenja / Oliver Vugrek (mentor); Oliver Vugrek (neposredni voditelj) . | Zagreb, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2010
Tlak Gajger, Ivana | Uspostavljanje sustava transpozon mutageneze za bakteriju Paenibacillus larvae / Vugrek, Oliver ; Petrinec, Zdravko (mentor). | Zagreb, Veterinarski fakultet, Zagreb, 2010
Članstva u profesionalnim udrugama / društvima
Hrvatsko društvo biokemičara i molekularnih biologa
Hrvatsko društvo za humanu genetiku
2020 - član Povjerenstva za provedbu deklaracije o suradnji prema dohvaćanju najmanje jednog miljuna sekvenciranih genoma EU do 2022. Godine
2020 – Nacionalni predstavnik specijalne grupe ‘Signatories of the Declaration of cooperation ‘Towards access to at least 1 million sequenced genomes in the EU by 2022’.
2021 – Nacionalni predstavnik RH u radnoj skupini 1+MG WG12 The Genome of Europe (GoE) pri Europskoj komisiji.