Znanstvena djelatnost LAB-a provodi se u okviru nekoliko istraživačkih tema:
a) Dijagnostika
• Razvoj, unaprijeđenje i prilagodba novih dijagnostičkih metoda/tehnika za procjenu i otkrivanje fizioloških/metaboličkih reakcija
• Razvoj i procjena bioloških indikatora stresa za postojeće i novouvedene uzgojne vrste
• Razvoj bioloških markera za detekciju disbalansa ekosustava na različitim razinama biološke organizacije
b) Imunomodulatori
• Istraživanje učinaka imunomodulatora na imunosni sustav (obrambenih mehanizama i reakcija) vodnih organizama te razvoj novih imunomodulatorskih bioaktivnih komponenti za primjenu u akvakulturi
c) Nove vrste u akvakulturi
• Uvođenje novih vrsta u akvakulturu
• Uvođenje, razvoj i harmonizacija metoda temeljenih na -omics istraživanjima u svrhu boljeg poznavanja fizioloških procesa novouvedenih vrsta u uvjetima uzgoja, prilagodbe postojećih tehnologija novim vrstama te unaprijeđenja kvalitete i zdravlja makrobiota

Biotehnološki pristup uz korištenje biokemijskih (kolorimetrijska, spektrofotometrijska, masena spektrometrija, plinska kromatografija, tekućinska kromatografija), histoloških/histokemijskih, mikrobioloških, molekularnih, elektrokemijskih metoda i tehnika uz numeričko modeliranje i inovativne tehnologije uzgoja, značajno doprinosi boljem razumijevanju interakcije akvakulture i okoliša:
a) Mikrobiološka istraživanja
• Istraživanje mikrobioma vodenih ekosustava molekularnim metodama za karakterizaciju mikroorganizama u okolišu
b) Ispitivanja toksičnosti
• Procjena potencijalne toksičnosti prirodnih spojeva uz pomoć brojnih biotestova kojima se testiraju učinci na različitim razinama biološke organizacije (primjena bakterijskih sojeva, akvatičnih i terestrijalnih vrsta kao modelnih organizama u procjeni bioaktivnih supstanci)
• Unaprijeđenje postojećih i razvoj novih biomarkera za testiranje širokog spektra potencijalno toksičnih spojeva
c) Karakterizacija antioksidansa
• Razvoj i validacija jednostavne, brze, pouzdane i osjetljive elektrokemijske metode za određivanje ukupnog antioksidativnog kapaciteta, pogodne za rutinske analize hrane u istraživačkim laboratorijima i industriji
• Detaljno ispitivanje mehanizama elektrokemijskog i antioksidativnog djelovanja antioksidativnih spojeva
d) Modeliranje vodenih ekosustava
• Analiza fizikalnih svojstava mora i formacije vodenih masa te izmjene topline između mora i zraka
• Analiza i modeliranje fizikalnih procesa u moru