Cilj ovog projekta je detaljno istražiti interakcije između onkobioma i signalnog puta Hedgehog (HH) u seroznom raku jajnika visokog gradusa (HGSOC). U svježim uzorcima HGSOC i zdravih jajovoda (FT) bakterijski sastav (bakteriom) bit će određen sekvenciranjem cijelog gena za 16S rRNA, ljudski i bakterijski transkriptom (određen dvostrukim RNA-sekvenciranjem) pokazat će koji su bakterijski geni eksprimirani, a koji ljudski geni mogu biti promijenjeni zbog infekcije, dok će metabolomika pokazati koji bakterijski metaboliti mogu uzrokovati malignu transformaciju stanica FT-a. Također će se uzorkovati stolica i bris vagine kako bi se potvrdila prisutnost bakterija, što također može rasvijetliti os crijevo-FT ili dovesti do razvoja neinvazivnih dijagnostičkih testova. Neovisni skup arhivskih tkiva HGSOC bit će korišten za daljnju potvrdu prisutnosti bakterija i proteinskih razina gena na koje utječu te bakterije, što bi također moglo dovesti do razvoja prognostičkih biomarkera. Konačno, ko-kultivirat ćemo zdrave stanične linije FT-a s bakterijama i modulirati signalni put HH kako bismo razjasnili molekularne mehanizme i biološke učinke. Povezanost između onkobioma, signalnog puta HH i HGSOC otvara nove mogućnosti za prevenciju, rano otkrivanje, stratifikaciju pacijenata i strategije liječenja.

Prvi model miopatije uzrokovane nedostatkom AHCY iz induciranih pluripotentnih matičnih stanica bolesnika, dugolančano sekvenciranje genoma od telomere do telomere i ispravak patogene varijante uređivanjem genoma. Projekt financira Hrvatska zaklada za znanost.

Razvoj automatiziranog sustava koji iz podataka o genomu daje farmakogenetske i nutrigenetske preporuke. Projekt sufinancira Europska unija iz Europskog fonda za regionalni razvoj.

Istraživanje i razvoj digitalnog novčanika (ID wallet) za sigurnu pohranu osobnog genoma, uz dugolančano cjelogenomsko sekvenciranje i automatsku analizu monogenskih bolesti. Projekt sufinancira Europska unija iz Europskog fonda za regionalni razvoj.

Europski projekt koji uspostavlja siguran kapacitet za pohranu i obradu genomskih podataka za inicijativu 1+ Million Genomes i budući Genome EDIC. Projekt sufinancira Europska unija iz programa Digitalna Europa.

Kolorektalni karcinom (CRC) snažno je povezan s pretilošću i šećernom bolešću tipa 2 (T2D), no mehanističke veze između metaboličke disregulacije, imunološkog remodeliranja i progresije tumora još uvijek nisu dovoljno razjašnjene.